抑制 R 中的 C 警告消息

Posted 2023-03-12

【中文标题】抑制 R 中的 C 警告消息

【英文标题】：Suppress C warning messages in R

【发布时间】：2012-02-09 04:25:30

【问题描述】：

我正在从与 libsvm（一个 C 程序）接口的 R 包 e1071 中调用一个 R 函数。此函数将 C (printf) 警告消息传递到 R 控制台。我知道这一点，因为警告消息的形式是（警告：...），而 R 警告消息是大写的（即警告：...）。

我已经尝试了一切来消除 R 中的这些消息（接收器、suppressWarnings、不可见），但似乎没有任何效果。

有什么想法吗？

谢谢！

【问题讨论】：

为什么这么模糊？您是否通过 R 包连接到 libsvm？或者你正在做一些定制的事情？ GCC 是一个编译器，我怀疑运行时警告是否来自它，更有可能它们是 libsvm C 代码中的 printfs。

是的 e1071 包 - 我认为你是对的，这些消息来自 printf 语句。我需要进入C代码并删除它吗？或者我可以从 R 做些什么？

我也不记得曾经在我的机器上安装过 libsvm，我只是下载了 R 包。这是否意味着 libsvm 源代码在 R 包中？

我认为这与your recent question和your other recent question有关。尝试将它们都放在同一个地方。

如果有帮助，打印消息的代码位于 e1071 包源中的文件 src/svm.cpp 中。

【参考方案1】：

该函数使用 stdio 而不是 Rprintf/REprintf 或 warning，这就是 R 输出重定向不起作用的原因。正确的解决方案是修复 libsvm 中的调用以使用 R 输出。

破解 stdio 输出是可能的 - 你可以将输出重定向到你自己的管道并用它做你想做的事，但是 a）它在 C 中有点工作，b）它是很危险，因为您需要在使用完函数后恢复标准行为 - 即使它出错，并且 c) in 如果在 shell 上使用可能会与 R 输出交互。

如果你想要一个非常古怪、肮脏但快速的解决方案，请在 collect(parallel(..., silent=TRUE))[[1]] 中从 multicore 运行你的函数 - 它会抑制 stdout（如果你想抑制 ，可以添加 multicore:::closeStderr() em>stderr 也是如此）。