将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?

Posted

技术标签:

【中文标题】将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?【英文标题】:Convert Pandas dataframe to PyTorch tensor? 【发布时间】:2018-10-22 18:41:54 【问题描述】:

我想用 PyTorch 在 pandas 数据帧 df 上训练一个简单的神经网络。

其中一列名为"Target",它是网络的目标变量。如何将此数据帧用作 PyTorch 网络的输入?

我试过了,但它不起作用:

import pandas as pd
import torch.utils.data as data_utils

target = pd.DataFrame(df['Target'])
train = data_utils.TensorDataset(df, target)
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size=10, shuffle=True)

【问题讨论】:

欢迎来到 ***!请阅读how to ask a question(尤其是how to create a good example)以获得良好的响应。 问题: 您的特征 (df) 还包含目标变量 (df['Target'])(即您的网络在“作弊”,因为它可以看到结果为输入) 【参考方案1】:
#This works for me

target = torch.tensor(df['Targets'].values)
features = torch.tensor(df.drop('Targets', axis = 1).values)

train = data_utils.TensorDataset(features, target)
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size=10, shuffle=True)

【讨论】:

您好,感谢您的贡献!与@iacob 的答案有什么不同? 嗨,我必须先将目标和特征转换为 torch.tensor。【参考方案2】:

您可以将df.values 属性(一个numpy 数组)直接传递给Dataset 构造函数:

import torch.utils.data as data_utils

# Creating np arrays
target = df['Target'].values
features = df.drop('Target', axis=1).values

# Passing to DataLoader
train = data_utils.TensorDataset(features, target)
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size=10, shuffle=True)

注意:您的特征 (df) 还包含目标变量 (df['Target']),即您的网络在“作弊”,因为它可以看到输入中的目标。您需要从特征集中删除此列。

【讨论】:

【参考方案3】:

您可以使用以下函数将任何数据框或熊猫系列转换为 pytorch 张量

import pandas as pd
import torch

# determine the supported device
def get_device():
    if torch.cuda.is_available():
        device = torch.device('cuda:0')
    else:
        device = torch.device('cpu') # don't have GPU 
    return device

# convert a df to tensor to be used in pytorch
def df_to_tensor(df):
    device = get_device()
    return torch.from_numpy(df.values).float().to(device)

df_tensor = df_to_tensor(df)
series_tensor = df_to_tensor(series)

【讨论】:

【参考方案4】:

只需转换pandas dataframe -> numpy array -> pytorch tensor。这方面的一个例子如下所述:

import pandas as pd
import numpy as np
import torch

df = pd.read_csv('train.csv')
target = pd.DataFrame(df['target'])
del df['target']
train = data_utils.TensorDataset(torch.Tensor(np.array(df)), torch.Tensor(np.array(target)))
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size = 10, shuffle = True)

希望这将帮助您使用 pytorch(与最新版本的 pytorch 兼容)创建自己的数据集。

【讨论】:

【参考方案5】:

也许试试这个看看它是否可以解决你的问题(基于你的示例代码)?

train_target = torch.tensor(train['Target'].values.astype(np.float32))
train = torch.tensor(train.drop('Target', axis = 1).values.astype(np.float32)) 
train_tensor = data_utils.TensorDataset(train, train_target) 
train_loader = data_utils.DataLoader(dataset = train_tensor, batch_size = batch_size, shuffle = True)

【讨论】:

【参考方案6】:

我指的是标题中的问题,因为您没有在文本中真正指定任何其他内容,因此只需将 DataFrame 转换为 PyTorch 张量。

没有关于您的数据的信息,我只是将浮点值作为示例目标。

将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?

import pandas as pd
import torch
import random

# creating dummy targets (float values)
targets_data = [random.random() for i in range(10)]

# creating DataFrame from targets_data
targets_df = pd.DataFrame(data=targets_data)
targets_df.columns = ['targets']

# creating tensor from targets_df 
torch_tensor = torch.tensor(targets_df['targets'].values)

# printing out result
print(torch_tensor)

输出:

tensor([ 0.5827,  0.5881,  0.1543,  0.6815,  0.9400,  0.8683,  0.4289,
         0.5940,  0.6438,  0.7514], dtype=torch.float64)

使用 Pytorch 0.4.0 测试。

我希望这会有所帮助,如果您还有其他问题 - 请尽管提问。 :)

【讨论】:

使用你的代码我写了这个:train_target = torch.tensor(train['Target'].values) train = torch.tensor(train.drop('Target', axis = 1).values) train_tensor = data_utils.TensorDataset(train, train_target) train_loader = data_utils.DataLoader(dataset = train_tensor, batch_size = batch_size, shuffle = True) 运行神经网络模型我得到这个错误:RuntimeError: Expected object of type torch.FloaTtensor but found type torch.DoubleTensor for argument #4 'mat1' 您使用的是什么 PyTorch 版本?版本 0.3.1. 与版本 0.4.0. 非常不同。 你的 DataFrame 是什么样子的?最好是更新您的问题,否则将很难重现您的问题。 只是为了记录,在术语上:您不是在转换熊猫 DataFrame,而是熊猫系列(您首先将其强制转换为应用 .values 的数组)。 张量是多维的(否则我们称它们为向量和矩阵)。您能否展示从 DataFrame 的列(系列)构建 3D 火炬张量?

以上是关于将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

将 Pandas 数据帧转换为 Dask 数据帧

将 pandas 数据帧转换为 json 对象 - pandas

将 Pandas 数据帧转换为 Spark 数据帧的 TypeError

将 spark 数据帧转换为 pandas 数据帧 - ImportError: Pandas >= 0.19.2 must be installed

Pandas 将数据帧转换为元组数组

使用 Python3 将 Bytes 对象转换为 Pandas 数据帧会产生一个空数据帧。为啥?