将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?
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【中文标题】将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?【英文标题】:Convert Pandas dataframe to PyTorch tensor? 【发布时间】:2018-10-22 18:41:54 【问题描述】:我想用 PyTorch 在 pandas 数据帧 df
上训练一个简单的神经网络。
其中一列名为"Target"
,它是网络的目标变量。如何将此数据帧用作 PyTorch 网络的输入?
我试过了,但它不起作用:
import pandas as pd
import torch.utils.data as data_utils
target = pd.DataFrame(df['Target'])
train = data_utils.TensorDataset(df, target)
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size=10, shuffle=True)
【问题讨论】:
欢迎来到 ***!请阅读how to ask a question(尤其是how to create a good example)以获得良好的响应。 问题: 您的特征 (df
) 还包含目标变量 (df['Target']
)(即您的网络在“作弊”,因为它可以看到结果为输入)
【参考方案1】:
#This works for me
target = torch.tensor(df['Targets'].values)
features = torch.tensor(df.drop('Targets', axis = 1).values)
train = data_utils.TensorDataset(features, target)
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size=10, shuffle=True)
【讨论】:
您好,感谢您的贡献!与@iacob 的答案有什么不同? 嗨,我必须先将目标和特征转换为 torch.tensor。【参考方案2】:您可以将df.values
属性(一个numpy 数组)直接传递给Dataset 构造函数:
import torch.utils.data as data_utils
# Creating np arrays
target = df['Target'].values
features = df.drop('Target', axis=1).values
# Passing to DataLoader
train = data_utils.TensorDataset(features, target)
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size=10, shuffle=True)
注意:您的特征 (df
) 还包含目标变量 (df['Target']
),即您的网络在“作弊”,因为它可以看到输入中的目标。您需要从特征集中删除此列。
【讨论】:
【参考方案3】:您可以使用以下函数将任何数据框或熊猫系列转换为 pytorch 张量
import pandas as pd
import torch
# determine the supported device
def get_device():
if torch.cuda.is_available():
device = torch.device('cuda:0')
else:
device = torch.device('cpu') # don't have GPU
return device
# convert a df to tensor to be used in pytorch
def df_to_tensor(df):
device = get_device()
return torch.from_numpy(df.values).float().to(device)
df_tensor = df_to_tensor(df)
series_tensor = df_to_tensor(series)
【讨论】:
【参考方案4】:只需转换pandas dataframe -> numpy array -> pytorch tensor
。这方面的一个例子如下所述:
import pandas as pd
import numpy as np
import torch
df = pd.read_csv('train.csv')
target = pd.DataFrame(df['target'])
del df['target']
train = data_utils.TensorDataset(torch.Tensor(np.array(df)), torch.Tensor(np.array(target)))
train_loader = data_utils.DataLoader(train, batch_size = 10, shuffle = True)
希望这将帮助您使用 pytorch(与最新版本的 pytorch 兼容)创建自己的数据集。
【讨论】:
【参考方案5】:也许试试这个看看它是否可以解决你的问题(基于你的示例代码)?
train_target = torch.tensor(train['Target'].values.astype(np.float32))
train = torch.tensor(train.drop('Target', axis = 1).values.astype(np.float32))
train_tensor = data_utils.TensorDataset(train, train_target)
train_loader = data_utils.DataLoader(dataset = train_tensor, batch_size = batch_size, shuffle = True)
【讨论】:
【参考方案6】:我指的是标题中的问题,因为您没有在文本中真正指定任何其他内容,因此只需将 DataFrame 转换为 PyTorch 张量。
没有关于您的数据的信息,我只是将浮点值作为示例目标。
将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?
import pandas as pd
import torch
import random
# creating dummy targets (float values)
targets_data = [random.random() for i in range(10)]
# creating DataFrame from targets_data
targets_df = pd.DataFrame(data=targets_data)
targets_df.columns = ['targets']
# creating tensor from targets_df
torch_tensor = torch.tensor(targets_df['targets'].values)
# printing out result
print(torch_tensor)
输出:
tensor([ 0.5827, 0.5881, 0.1543, 0.6815, 0.9400, 0.8683, 0.4289,
0.5940, 0.6438, 0.7514], dtype=torch.float64)
使用 Pytorch 0.4.0 测试。
我希望这会有所帮助,如果您还有其他问题 - 请尽管提问。 :)
【讨论】:
使用你的代码我写了这个:train_target = torch.tensor(train['Target'].values) train = torch.tensor(train.drop('Target', axis = 1).values) train_tensor = data_utils.TensorDataset(train, train_target) train_loader = data_utils.DataLoader(dataset = train_tensor, batch_size = batch_size, shuffle = True)
运行神经网络模型我得到这个错误:RuntimeError: Expected object of type torch.FloaTtensor but found type torch.DoubleTensor for argument #4 'mat1'
您使用的是什么 PyTorch 版本?版本 0.3.1.
与版本 0.4.0.
非常不同。
你的 DataFrame 是什么样子的?最好是更新您的问题,否则将很难重现您的问题。
只是为了记录,在术语上:您不是在转换熊猫 DataFrame,而是熊猫系列(您首先将其强制转换为应用 .values
的数组)。
张量是多维的(否则我们称它们为向量和矩阵)。您能否展示从 DataFrame 的列(系列)构建 3D 火炬张量?以上是关于将 Pandas 数据帧转换为 PyTorch 张量?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
将 pandas 数据帧转换为 json 对象 - pandas
将 Pandas 数据帧转换为 Spark 数据帧的 TypeError
将 spark 数据帧转换为 pandas 数据帧 - ImportError: Pandas >= 0.19.2 must be installed