Sklearn Pipeline ValueError:无法将字符串转换为浮点数

Posted

技术标签:

【中文标题】Sklearn Pipeline ValueError:无法将字符串转换为浮点数【英文标题】:Sklearn Pipeline ValueError: could not convert string to float 【发布时间】:2019-02-06 22:24:00 【问题描述】:

我是第一次玩 sklearn 和 NLP,并认为我理解我所做的一切,直到我不知道如何修复这个错误。以下是相关代码(大部分改编自http://zacstewart.com/2015/04/28/document-classification-with-scikit-learn.html):

from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
from sklearn.pipeline import Pipeline, FeatureUnion
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.decomposition import TruncatedSVD
from sgboost import XGBClassifier
from pandas import DataFrame

def read_files(path):
    for article in os.listdir(path):
        with open(os.path.join(path, doc)) as f:
            text = f.read()
        yield os.path.join(path, article), text

def build_data_frame(path, classification)
    rows = []
    index = []
    for filename, text in read_files(path):
        rows.append('text': text, 'class': classification)
        index.append(filename)
    df = DataFrame(rows, index=index)
    return df

data = DataFrame('text': [], 'class': [])
for path, classification in SOURCES: # SOURCES is a list of tuples
    data = data.append(build_data_frame(path, classification))
data = data.reindex(np.random.permutation(data.index))

classifier = Pipeline([
    ('features', FeatureUnion([
        ('text', Pipeline([
            ('tfidf', TfidfVectorizer()),
            ('svd', TruncatedSVD(algorithm='randomized', n_components=300)
            ])),
        ('words', Pipeline([('wscaler', StandardScaler())])),
    ])),
    ('clf, XGBClassifier(silent=False)),
])
classifier.fit(data['text'].values, data['class'].values)

加载到 DataFrame 中的数据是经过预处理的文本,其中包含所有停用词、标点符号、unicode、大写字母等。这是我在分类器上调用 fit 时遇到的错误,其中 ... 表示应该在管道中进行 vecorized 的文档之一:

ValueError: could not convert string to float: ...

我一开始以为 TfidfVectorizer() 不起作用,导致 SVD 算法出错,但是在我从管道中提取每个步骤并按顺序执行它们之后,同样的错误只出现在 XGBClassifer.fit() 上。

让我更困惑的是,我试图在解释器中逐步拆分这个脚本,但是当我尝试导入 read_files 或 build_data_frame 时,同样的 ValueError 出现了我的一个字符串,但这是仅仅在:

from classifier import read_files

我不知道这是怎么发生的,如果有人知道我的明显错误可能是什么,我将不胜感激。试图独自思考这些概念,但遇到这样的问题让我感到非常无能为力。

【问题讨论】:

【参考方案1】:

管道的第一部分是FeatureUnionFeatureUnion 会将它获得的所有数据并行传递给所有内部部件。 FeatureUnion 的第二部分是一个包含单个 StandardScaler 的管道。这就是错误的来源。

这是您的数据流:

X --> classifier, Pipeline
            |
            |  <== X is passed to FeatureUnion
            \/
      features, FeatureUnion
                      |
                      |  <== X is duplicated and passed to both parts
        ______________|__________________
       |                                 |
       |  <===   X contains text  ===>   |                         
       \/                               \/
   text, Pipeline                   words, Pipeline
           |                                  |   
           |  <===    Text is passed  ===>    |
          \/                                 \/ 
       tfidf, TfidfVectorizer            wscaler, StandardScaler  <== Error
                 |                                   |
                 | <==Text converted to floats       |
                \/                                   |
              svd, TruncatedSVD                      |
                       |                             |
                       |                             |
                      \/____________________________\/
                                      |
                                      |
                                     \/
                                   clf, XGBClassifier

由于将文本传递给StandardScaler,因此引发错误,StandardScaler 只能与数字特征一起使用。

正如您使用 TfidfVectorizer 将文本转换为数字一样,在将其发送到 TruncatedSVD 之前,您需要在 StandardScaler 之前执行相同的操作,否则只为其提供数字特征。

看有问题的描述,你打算在TruncatedSVD的结果之后保留StandardScaler吗?

【讨论】:

太棒了,这很有帮助。我不明白 FeatureUnion 并行化它的输入。 StandardScaler 是我仍在纠结的另一个难题。我读过很多分类器需要它来规范化数据,所以我保留了它

以上是关于Sklearn Pipeline ValueError:无法将字符串转换为浮点数的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

sklearn.pipeline.Pileline

如何使用 sklearn.pipeline 转换新数据

sklearn:无法使 OneHotEncoder 与 Pipeline 一起使用

Sklearn ColumnTransformer + Pipeline = TypeError

使用 sklearn Pipeline 和 MultiOutputRegressor 访问属性

sklearn Pipeline 和 DataFrameMapper 有啥区别?