pydot.InvocationException：未找到 GraphViz 的可执行文件

Posted 2023-03-12

【中文标题】pydot.InvocationException：未找到 GraphViz 的可执行文件

【英文标题】：pydot.InvocationException: GraphViz's executables not found

【发布时间】：2015-02-24 08:08:42

【问题描述】：

我尝试运行this example 进行决策树学习，但收到以下错误消息：

文件“coco.py”，第 18 行，在 graph.write_pdf("iris.pdf") 文件 "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pydot.py", 第 1602 行，在 lambda 路径, f=frmt, prog=self.prog : self.write(path, format=f, prog=prog)) 文件 "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pydot.py", 第 1696 行，写入 dot_fd.write(self.create(prog, format)) 文件“/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pydot.py”, 第 1727 行，在创建中 'GraphViz\'s executables not found' ) pydot.InvocationException: GraphViz's executables not found

我看到this post 有类似的错误，但即使我遵循他们的解决方案（卸载然后以相反的顺序重新安装 graphviz 和 pydot），问题仍然存在......我使用的是 MacOS（优胜美地）。

有什么想法吗？非常感谢您的帮助。

【问题讨论】：

请在您的问题中添加您如何安装 graphviz（例如 homebrew、macports 等）。您的 PATH 变量似乎存在问题。

我用过 pip，所以没什么特别的...（sudo pip install graphviz）。

我可以通过手动更改路径变量来修复它吗？如果可以，怎么做？

Graphviz 不是 python 工具。 pypi 的 python 包提供了一种在 python 代码中使用 Graphviz 的便捷方式。您仍然需要安装Graphviz 可执行文件，它们不是pythonic，因此这些软件包不附带。您可以安装这些，例如使用通用包管理器，例如 homebrew

太棒了！我永远的感激之情-谢谢！

【参考方案1】：

cel，在评论中回答了这个问题：

Graphviz 不是 Python 工具。 pypi 的 python 包提供了一个 在 python 代码中使用 Graphviz 的便捷方式。你还是要 安装 Graphviz 可执行文件，它们不是 pythonic，因此不是 随这些包裹一起提供。您可以安装这些，例如有一个 通用包管理器，例如自制软件

就我个人而言，在 ubuntu 14.04 上，我所要做的就是：

sudo apt-get install graphviz

【参考方案2】：

brew install graphviz
pip install -U pydotplus

...在 MacOSX 上为我工作

【讨论】：

此解决方案适用于 MacOS Mojave 版本 10.14.5

【参考方案3】：

在 Windows 8 上，这为我解决了同样的问题：

import os     
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

【讨论】：

一个更持久的解决方案是在适当的配置文件中设置环境的PATH变量（在*nix系统上这通常是~/.bashrc）。

【参考方案4】：

我在用pip安装pydot和graphviz时遇到了同样的问题，然后我找到了答案here。

特别是，我首先卸载了我使用 pip 单独安装的 pydot 和 graphviz（使用 sudo pip uninstall pydot 和 graphviz 相同）。然后，我运行 sudo apt-get install python-pydot 解决了这个问题。

【参考方案5】：

conda install -c anaconda graphviz        
conda install -c anaconda pydot

【讨论】：

这对我来说就像在 ios 上的魅力一样。谢谢，@scarin

注意 mac 用户，这是你的答案 - 谢谢，吓人！！

Mac 用户不要这样做，你已经重新安装了所有其他模块。

【参考方案6】：

对于 Windows 用户： 1.安装 Graphviz 2.将Graphviz路径添加到PATH变量 3.重启 PyCharm 或其他编译器。

从 2.31 版开始，Visual Studio 包不再更改 PATH 变量或访问注册表。如果您希望使用 Graphviz 的命令行界面或使用其他调用 Graphviz 程序的程序，则需要自己设置 PATH 变量。

【参考方案7】：

在 Ubuntu 18.04 上也为我工作：

$ sudo apt-get install graphviz  

【参考方案8】：

如果您使用的是 mac 操作系统，那么您可能会遇到这个问题。我已经用 pip 安装了 graphviz ，但是可以正常工作。所以我不得不再次用 brew 安装它并为我工作。

使用以下命令

brew install graphviz

【讨论】：

或arch -arm64 brew install graphviz - 谢谢

【参考方案9】：

我遇到了同样的问题，我的问题得到了解决：

运行命令sudo port install graphviz 如果端口出现错误，则首先根据您使用的版本从下面安装端口 https://guide.macports.org/chunked/installing.macports.html 安装后端口运行命令sudo port install graphviz

如果您正在使用 iPython，请重新启动 python 内核并再次运行。

【参考方案10】：

在 mac 上，使用 Brew 安装 graphviz 而不是 pip，请参见链接：

graphviz 信息：http://www.graphviz.org/download/

brew 安装：https://brew.sh/

所以安装 brew 后在终端中输入以下内容应该可以工作：

brew install graphviz

【参考方案11】：

我确实遇到了类似的问题，纠正的方法是改变路径。

这就是我所做的：

将“graphiz”路径从您的计算机复制到环境变量>控制面板中的路径

示例： Graphiz 路径：C:\Apps\Program Files\Continuum\Anaconda2\Library\bin\graphviz)

（我已经将它安装在 Apps 文件夹中。它可能在你的不同路径中）

在环境变量中设置路径：

转到控制面板>控制面板\系统和安全\系统。单击高级设置，然后单击高级。您将在右下角找到环境变量。单击路径进行编辑并保存。关闭您的 IDE 并重新打开它。

它对我有用。

【参考方案12】：

我建议避免使用graphviz。 使用以下替代方法

from sklearn.tree import plot_tree
plt.figure(figsize=(60,30))
plot_tree(dt, filled=True);