Apache Spark 中的 RandomForestClassifier 输入带有无效标签列错误
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【中文标题】Apache Spark 中的 RandomForestClassifier 输入带有无效标签列错误【英文标题】:RandomForestClassifier was given input with invalid label column error in Apache Spark 【发布时间】:2016-07-30 18:17:28 【问题描述】:我正在尝试使用 SCALA 中的随机森林分类器模型使用 5 折交叉验证来查找准确性。但我在运行时收到以下错误:
java.lang.IllegalArgumentException: RandomForestClassifier 的输入带有无效的标签列标签,没有指定类的数量。请参阅字符串索引器。
出现上述错误---> val cvModel = cv.fit(trainingData)
我使用随机森林对数据集进行交叉验证的代码如下:
import org.apache.spark.ml.Pipeline
import org.apache.spark.ml.tuning.ParamGridBuilder, CrossValidator
import org.apache.spark.ml.classification.RandomForestClassifier
import org.apache.spark.ml.evaluation.MulticlassClassificationEvaluator
import org.apache.spark.mllib.linalg.Vectors
import org.apache.spark.mllib.regression.LabeledPoint
val data = sc.textFile("exprogram/dataset.txt")
val parsedData = data.map line =>
val parts = line.split(',')
LabeledPoint(parts(41).toDouble,
Vectors.dense(parts(0).split(',').map(_.toDouble)))
val splits = parsedData.randomSplit(Array(0.6, 0.4), seed = 11L)
val training = splits(0)
val test = splits(1)
val trainingData = training.toDF()
val testData = test.toDF()
val nFolds: Int = 5
val NumTrees: Int = 5
val rf = new
RandomForestClassifier()
.setLabelCol("label")
.setFeaturesCol("features")
.setNumTrees(NumTrees)
val pipeline = new Pipeline()
.setStages(Array(rf))
val paramGrid = new ParamGridBuilder()
.build()
val evaluator = new MulticlassClassificationEvaluator()
.setLabelCol("label")
.setPredictionCol("prediction")
.setMetricName("precision")
val cv = new CrossValidator()
.setEstimator(pipeline)
.setEvaluator(evaluator)
.setEstimatorParamMaps(paramGrid)
.setNumFolds(nFolds)
val cvModel = cv.fit(trainingData)
val results = cvModel.transform(testData)
.select("label","prediction").collect
val numCorrectPredictions = results.map(row =>
if (row.getDouble(0) == row.getDouble(1)) 1 else 0).foldLeft(0)(_ + _)
val accuracy = 1.0D * numCorrectPredictions / results.size
println("Test set accuracy: %.3f".format(accuracy))
谁能解释一下上面代码中的错误是什么。
【问题讨论】:
【参考方案1】:RandomForestClassifier
与许多其他 ML 算法一样,需要在标签列上设置特定的元数据,并且标签值是 [0, 1, 2 ..., #classes) 中的整数值,表示为双精度值。通常这由上游Transformers
处理,例如StringIndexer
。由于您手动转换标签,因此未设置元数据字段,分类器无法确认满足这些要求。
val df = Seq(
(0.0, Vectors.dense(1, 0, 0, 0)),
(1.0, Vectors.dense(0, 1, 0, 0)),
(2.0, Vectors.dense(0, 0, 1, 0)),
(2.0, Vectors.dense(0, 0, 0, 1))
).toDF("label", "features")
val rf = new RandomForestClassifier()
.setFeaturesCol("features")
.setNumTrees(5)
rf.setLabelCol("label").fit(df)
// java.lang.IllegalArgumentException: RandomForestClassifier was given input ...
您可以使用StringIndexer
重新编码标签列:
import org.apache.spark.ml.feature.StringIndexer
val indexer = new StringIndexer()
.setInputCol("label")
.setOutputCol("label_idx")
.fit(df)
rf.setLabelCol("label_idx").fit(indexer.transform(df))
或set required metadata manually:
val meta = NominalAttribute
.defaultAttr
.withName("label")
.withValues("0.0", "1.0", "2.0")
.toMetadata
rf.setLabelCol("label_meta").fit(
df.withColumn("label_meta", $"label".as("", meta))
)
注意:
使用StringIndexer
创建的标签取决于频率而不是值:
indexer.labels
// Array[String] = Array(2.0, 0.0, 1.0)
PySpark:
在 Python 中,元数据字段可以直接在模式上设置:
from pyspark.sql.types import StructField, DoubleType
StructField(
"label", DoubleType(), False,
"ml_attr":
"name": "label",
"type": "nominal",
"vals": ["0.0", "1.0", "2.0"]
)
【讨论】:
以上是关于Apache Spark 中的 RandomForestClassifier 输入带有无效标签列错误的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
为啥 org.apache.spark.sql.types.DecimalType 在 Spark SQL 中的最大精度值为 38?
Spark改进|Apache Spark 3.0中的SQL性能改进概览