在文本中很好地打印决策树/使用自定义控件 [r]

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【中文标题】在文本中很好地打印决策树/使用自定义控件 [r]【英文标题】:print decision tree in text nicely / with custom control [r] 【发布时间】:2018-11-22 05:29:29 【问题描述】:

我想用文本很好地打印决策树。例如,我可以打印树对象本身:

library(rpart)

f = as.formula('Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width + Species')
fit = rpart(f, data = iris, control = rpart.control(xval = 3))

fit

产量

n= 150 

node), split, n, deviance, yval
      * denotes terminal node

 1) root 150 102.1683000 5.843333  
   2) Petal.Length< 4.25 73  13.1391800 5.179452  
     4) Petal.Length< 3.4 53   6.1083020 5.005660  
       8) Sepal.Width< 3.25 20   1.0855000 4.735000 *
       9) Sepal.Width>=3.25 33   2.6696970 5.169697 *
... # omitted

partykit 打印更整洁:

library(partykit)

as.party(fit)

产量

Model formula:
Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width + Species

Fitted party:
[1] root
|   [2] Petal.Length < 4.25
|   |   [3] Petal.Length < 3.4
|   |   |   [4] Sepal.Width < 3.25: 4.735 (n = 20, err = 1.1)
|   |   |   [5] Sepal.Width >= 3.25: 5.170 (n = 33, err = 2.7)
|   |   [6] Petal.Length >= 3.4: 5.640 (n = 20, err = 1.2)
...# omitted

Number of inner nodes:    6
Number of terminal nodes: 7

有没有办法让我拥有更多控制权?例如,我不想打印nerr,或者想要标准差而不是打印err

【问题讨论】:

【参考方案1】:

不是一个非常优雅的答案,但如果您只是想摆脱n=err=,您可以捕获输出并对其进行编辑。

CO = capture.output(print(as.party(fit)))
CO2 = sub("\\(.*\\)", "", CO)
cat(paste(CO2, collapse="\n"))

Model formula:
Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width + Species

Fitted party:
[1] root
|   [2] Petal.Length < 4.25
|   |   [3] Petal.Length < 3.4
|   |   |   [4] Sepal.Width < 3.25: 4.735 
|   |   |   [5] Sepal.Width >= 3.25: 5.170 
|   |   [6] Petal.Length >= 3.4: 5.640 
|   [7] Petal.Length >= 4.25

我不确定您要插入什么标准差,但我希望您可以用相同的方式对其进行编辑。

【讨论】:

【参考方案2】:

party 对象的print() 方法非常灵活,可以通过各种面板功能和自定义进行控制。有关概述,请参阅?print.party。不过,文档有些简短且技术性很强。

在您的情况下,最简单的解决方案是设置响应 y、案例权重 w(在您的案例中默认为全 1)和所需数量的 digits 的函数:

myfun <- function(y, w, digits = 2) 
  n <- sum(w)
  m <- weighted.mean(y, w)
  s <- sqrt(weighted.mean((y - m)^2, w) * n/(n - 1))
  sprintf("%s (serr = %s)",
    round(m, digits = digits),
    round(s, digits = digits))

然后您可以将其传递给您的print() 电话:

p <- as.party(fit)
print(p, FUN = myfun)
## Model formula:
## Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width + Species
## 
## Fitted party:
## [1] root
## |   [2] Petal.Length < 4.25
## |   |   [3] Petal.Length < 3.4
## |   |   |   [4] Sepal.Width < 3.25: 4.735 (serr = 0.239)
## |   |   |   [5] Sepal.Width >= 3.25: 5.17 (serr = 0.289) 
## |   |   [6] Petal.Length >= 3.4: 5.64 (serr = 0.25)  
## |   [7] Petal.Length >= 4.25
## |   |   [8] Petal.Length < 6.05
## |   |   |   [9] Petal.Length < 5.15
## |   |   |   |   [10] Sepal.Width < 3.05: 6.055 (serr = 0.404)
## |   |   |   |   [11] Sepal.Width >= 3.05: 6.53 (serr = 0.38)  
## |   |   |   [12] Petal.Length >= 5.15: 6.604 (serr = 0.302)
## |   |   [13] Petal.Length >= 6.05: 7.578 (serr = 0.228)
## 
## Number of inner nodes:    6
## Number of terminal nodes: 7

【讨论】:

以上是关于在文本中很好地打印决策树/使用自定义控件 [r]的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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