如何为 ctree(打包方)的终端节点添加标签?
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【中文标题】如何为 ctree(打包方)的终端节点添加标签?【英文标题】:How to add labels to the terminal nodes of a ctree (package party)? 【发布时间】:2012-07-12 01:41:26 【问题描述】:我使用 ctree 创建了一个二叉分类树。我希望每个终端节点都包含与该节点关联的行名。我怎样才能做到这一点?
例如,对于下面的数据集,我希望最左边的节点分别列出所有年龄
names age height young
1 Abner 18 76.1 yes
2 Abraham 19 77.0 yes
3 Abram 20 78.1 yes
4 Abrasha 21 78.2 yes
5 Absalom 22 78.8 yes
6 Abudemio 23 79.7 yes
7 Abundiantus 24 79.9 no
8 Acacio 25 81.1 no
9 Acario 26 81.2 no
10 Accursius 27 81.8 no
11 Ace 28 82.8 no
12 Acelin 29 83.5 no
。
【问题讨论】:
【参考方案1】:这里是一个 hacky 解决方案。它只需要对 party
包中的绘图函数的原始源代码进行很少的修改。通过阅读源代码,我注意到有一个terminal_panel
正在调用node_barplot
,以防结果是一个因素。 (一切都在R/plot.R
函数中,如果你安装了源码包的话。)我们可以修改后面的,在默认的条形图中显示自定义标签。
只需在 R 提示符下发出以下命令:
fixInNamespace("node_barplot", pos="package:party")
然后,开始添加我们想要的内容:
-
将
labels = NULL, gp = NULL
添加到该函数的现有参数列表中。
在函数体末尾附近,grid.rect(gp = gpar(fill = "transparent"))
之后,添加以下几行:
if (!is.null(labels))
labs <- as.character(labels[ctreeobj@where==node$nodeID])
len <- length(labs)
x <- unit(rep(0.5, len), "npc")
y <- unit(0.5:len/len, "npc")
for (i in 1:len)
grid.text(labs[i], x=x[i], y=y[i], just="center", gp=gp)
这里的关键思想是选择与选中节点(node$nodeID
)对应的标签,我们可以从ctree
对象的槽where
中获取这个信息(这是一个向量,表示在哪个节点每个案例都结束了)。 if
测试只是为了确保我们可以使用最初编写的函数。 gp
参数可用于更改字体大小或颜色。
现在对该函数的典型调用是:
plot(cfit, tp_pars=list(labels=dfrm$names))
其中dfrm$names
是来自名为dfrm
的数据框的一列标签。这是您的数据的插图:
cfit <- ctree(young ~ age, data=a,
controls=ctree_control(minsplit=2, minbucket=2))
plot(cfit, tp_args=list(labels=a$names, gp=gpar(fontsize=8, col="darkgrey")))
(我还使用iris
数据集的在线示例对此进行了测试。)
【讨论】:
非常好,正是我想要的。以上是关于如何为 ctree(打包方)的终端节点添加标签?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章