绘制 lm 对象的 95% 置信区间
Posted
技术标签:
【中文标题】绘制 lm 对象的 95% 置信区间【英文标题】:Plotting a 95% confidence interval for a lm object 【发布时间】:2018-03-09 15:14:30 【问题描述】:如何计算和绘制 r 回归的置信区间?到目前为止,我有两个长度相等的数值向量(x,y)和一个回归对象(lm.out)。在给定 x 的情况下,我制作了 y 的散点图,并将回归线添加到该图中。我正在寻找一种将 lm.out 的 95% 预测置信带添加到图中的方法。我试过使用预测功能,但我什至不知道从哪里开始:/。这是我目前的代码:
x=c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,0)
y=c(13,28,43,35,96,84,101,110,108,13)
lm.out <- lm(y ~ x)
plot(x,y)
regression.data = summary(lm.out) #save regression summary as variable
names(regression.data) #get names so we can index this data
a= regression.data$coefficients["(Intercept)","Estimate"] #grab values
b= regression.data$coefficients["x","Estimate"]
abline(a,b) #add the regression line
谢谢!
编辑:我已经查看了建议的副本,但不能完全了解它。
【问题讨论】:
***.com/questions/14069629/… Plotting Confidence Intervals的可能重复 我看了一下那个,它对我帮助不大。我不认为那张海报和我在寻找同样的东西。 【参考方案1】:你已经对新的数据向量使用了预测,这里是newx
。
x=c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,0)
y=c(13,28,43,35,96,84,101,110,108,13)
lm.out <- lm(y ~ x)
newx = seq(min(x),max(x),by = 0.05)
conf_interval <- predict(lm.out, newdata=data.frame(x=newx), interval="confidence",
level = 0.95)
plot(x, y, xlab="x", ylab="y", main="Regression")
abline(lm.out, col="lightblue")
lines(newx, conf_interval[,2], col="blue", lty=2)
lines(newx, conf_interval[,3], col="blue", lty=2)
编辑
正如 Ben 在评论中提到的,这可以通过 matlines
完成,如下所示:
plot(x, y, xlab="x", ylab="y", main="Regression")
abline(lm.out, col="lightblue")
matlines(newx, conf_interval[,2:3], col = "blue", lty=2)
【讨论】:
你可以很快通过matlines(newx, conf_interval[,2:3], ...)
@Ben Bolker 你会怎么做,我从来没用过matlines
@BenBolker TIL matpoints
和 matlines
是 matplot
的简写/points
/lines
的类似物,谢谢 :)
与matlines
我得到了:Error in matplot(x = x, y = y, type = type, lty = lty, lwd = lwd, pch = pch, : 'x' and 'y' must have same number of rows
用Lines
没问题,但在剧情中没有绘制任何东西【参考方案2】:
我要添加一个提示,在尝试@Alejandro Andrade 给出的方法时,它可以让我省去很多挫折:如果您的数据在数据框中,那么当您使用lm()
构建模型时,使用 data=
参数而不是 $
表示法。例如,使用
lm.out <- lm(y ~ x, data = mydata)
而不是
lm.out <- lm(mydata$y ~ mydata$x)
如果你做后者,那么这个语句
predict(lm.out, newdata=data.frame(x=newx), interval="confidence", level = 0.95)
似乎要么忽略使用newdata=
传递的新值,要么出现无提示错误。无论哪种方式,输出都是来自原始数据的预测,而不是新数据。
另外,请确保您的 x 变量在新数据框中具有相同的名称 在原来的。这更容易弄清楚,因为您确实会遇到错误,但提前知道它可能会为您节省一轮调试时间。
注意:尝试将此添加为评论,但没有足够的声望点。
【讨论】:
预测也有同样的问题!以上是关于绘制 lm 对象的 95% 置信区间的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章