异构 DataFrame 上的 StratifiedKfold
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【中文标题】异构 DataFrame 上的 StratifiedKfold【英文标题】:StratifiedKfold over heterogeneous DataFrame 【发布时间】:2016-10-27 05:52:33 【问题描述】:我有一个 pandas 数据帧,其中包含字符串和浮点列,为了训练 sklearn 管道,需要将它们分成平衡的切片。
理想情况下,我会在 DataFrame 上使用 StratifiedKFold 来获取较小的数据块以进行交叉验证。但它抱怨我有不可排序的类型,像这样:
import pandas as pd
from sklearn.cross_validation import StratifiedKFold
dataset = pd.DataFrame(
[
'title': 'Dábale arroz a la zorra el abad', 'size':1.2, 'target': 1,
'title': 'Ana lleva al oso la avellana', 'size':1.0, 'target': 1,
'title': 'No te enrollé yornetón', 'size':1.4, 'target': 0,
'title': 'Acá sólo tito lo saca', 'size':1.4, 'target': 0,
])
skfs = StratifiedKFold(dataset, n_folds=2)
>>> TypeError: unorderable types: str() > float()
有一些方法可以获取折叠索引并对 DataFrame 进行切片,但我认为这并不能保证我的类会保持平衡。
分割我的 DataFrame 的最佳方法是什么?
【问题讨论】:
【参考方案1】:StratifiedKFold
需要拆分次数,.split()
方法使用标签的类分布对样本进行分层。假设你的label
是target
,你会:
from sklearn.model_selection import StratifiedKFold
skf = StratifiedKFold(n_splits=2)
X=dataset.drop('target', axis=1)
y=dataset.target
for train_index, test_index in skf.split(X, y):
X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index]
y_train, y_test = y.iloc[train_index], y.iloc[test_index]
【讨论】:
自 0.18 版后已弃用:此模块将在 0.20 中删除。请改用 sklearn.model_selection.StratifiedKFold。 或者,不从数据集中删除任何内容,只需执行skf.split(dataset, dataset.target)
【参考方案2】:
sklearn.cross_validation.StratifiedKFold
自 0.18 版起已弃用,并将在 0.20 版中删除。所以这是另一种方法:
from sklearn.model_selection import StratifiedKFold
skf = StratifiedKFold(n_splits=2)
t = dataset.target
for train_index, test_index in skf.split(np.zeros(len(t)), t):
train = dataset.loc[train_index]
test = dataset.loc[test_index]
【讨论】:
使用iloc
可能更通用,因为我认为train_index
和test_index
给出行号以上是关于异构 DataFrame 上的 StratifiedKfold的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章