异构 DataFrame 上的 StratifiedKfold

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【中文标题】异构 DataFrame 上的 StratifiedKfold【英文标题】:StratifiedKfold over heterogeneous DataFrame 【发布时间】:2016-10-27 05:52:33 【问题描述】:

我有一个 pandas 数据帧,其中包含字符串和浮点列,为了训练 sklearn 管道,需要将它们分成平衡的切片。

理想情况下,我会在 DataFrame 上使用 StratifiedKFold 来获取较小的数据块以进行交叉验证。但它抱怨我有不可排序的类型,像这样:

import pandas as pd
from sklearn.cross_validation import StratifiedKFold

dataset = pd.DataFrame(
    [
        'title': 'Dábale arroz a la zorra el abad', 'size':1.2, 'target': 1,
        'title': 'Ana lleva al oso la avellana', 'size':1.0, 'target': 1,
        'title': 'No te enrollé yornetón', 'size':1.4, 'target': 0,
        'title': 'Acá sólo tito lo saca', 'size':1.4, 'target': 0,
    ])
skfs = StratifiedKFold(dataset, n_folds=2)

>>>  TypeError: unorderable types: str() > float()

有一些方法可以获取折叠索引并对 DataFrame 进行切片,但我认为这并不能保证我的类会保持平衡。

分割我的 DataFrame 的最佳方法是什么?

【问题讨论】:

【参考方案1】:

StratifiedKFold 需要拆分次数,.split() 方法使用标签的类分布对样本进行分层。假设你的labeltarget,你会:

from sklearn.model_selection import StratifiedKFold
skf = StratifiedKFold(n_splits=2)
X=dataset.drop('target', axis=1)
y=dataset.target
for train_index, test_index in skf.split(X, y):
    X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index]
    y_train, y_test = y.iloc[train_index], y.iloc[test_index]

【讨论】:

自 0.18 版后已弃用:此模块将在 0.20 中删除。请改用 sklearn.model_selection.StratifiedKFold。 或者,不从数据集中删除任何内容,只需执行skf.split(dataset, dataset.target)【参考方案2】:

sklearn.cross_validation.StratifiedKFold 自 0.18 版起已弃用,并将在 0.20 版中删除。所以这是另一种方法:

from sklearn.model_selection import StratifiedKFold

skf = StratifiedKFold(n_splits=2)
t = dataset.target
for train_index, test_index in skf.split(np.zeros(len(t)), t):
    train = dataset.loc[train_index]
    test = dataset.loc[test_index]

【讨论】:

使用iloc 可能更通用,因为我认为train_indextest_index 给出行号

以上是关于异构 DataFrame 上的 StratifiedKfold的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

Lesson4——Pandas DataFrame结构

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