如何使用 h5py 通过 szip 压缩访问 HDF5 数据集

Posted 2023-03-11

【中文标题】如何使用 h5py 通过 szip 压缩访问 HDF5 数据集

【英文标题】：How to access HDF5 dataset with szip compression using h5py

【发布时间】：2020-10-27 19:45:24

【问题描述】：

正如标题所说，我需要知道如何访问使用 h5py 进行 szip 压缩的 HDF5 文件的数据集。 这是我得到的错误：

IOError：无法读取数据（数据集：读取失败）

有人知道如何使用 h5py 访问这个数据集吗？

谢谢

【参考方案1】：

您使用什么系统来读取 HDF5 文件？ h5py 文档是这样说 SZIP 的：

UNIX：如果随 HDF5 提供。 Windows：只读

因此，如果您使用的是 Linux，则可能需要更新您的 HDF5 安装以添加 SZIP 压缩。参考这里：

Supported h5py compression/processing filters

【讨论】：

我正在使用 Ubuntu 的命令提示符。我会看看是否有任何更新可以解决这个问题。