numactl 和 move_pages 不匹配

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【中文标题】numactl 和 move_pages 不匹配【英文标题】:numactl and move_pages mismatch 【发布时间】:2019-01-18 12:41:31 【问题描述】:

我基于this question 开发了一个简单的程序来测试页面在哪个NUMA 节点中。

问题在于,将我的程序结果与 Xeon E5-2698 v4(两个 NUMA 节点)上的 numactl -H 进行比较会显示不同的输出。 numactl -H 显示(裁剪):

available: 2 nodes (0-1)
node 0 cpus: 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59
node 1 cpus: 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79

例如,numactl 表示 cpu 20 位于节点 1。我有以下代码:

#include <unistd.h>
#include <sys/mman.h>
#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <numaif.h>
#include <omp.h>

int numa_node(void *ptr) 
  int status;
  int ret_code;
  if((ret_code = move_pages(0, 1, &ptr, NULL, &status, 0)) == -1) 
    perror("move_pages");
    return -1;
  
  return status;


int main(int argc, char* argv[]) 
  int pgsize = getpagesize();
  printf("NUMA test(pgsize=%d)\n",pgsize);
  #pragma omp parallel firstprivate(pgsize)
  
    if(omp_get_thread_num() == 20) 
      char *m = aligned_alloc(pgsize, pgsize);
      m[0] = 'a';
      if(mlock(m, 10) == -1) 
        perror("mlock");
      
      else 
        int node = numa_node(m);
        printf("thread %d: node %d\n",20,node);
      
    
  

我正在使用aligned_alloc 试图分配一个页面,对齐,所以 当这个线程“触摸”这个页面时,它会被映射到这个线程所在的NUMA节点(第一次触摸策略)。然后我使用mlock,您可以查看this question。我想我正在使用第一次触摸,因为我没有修改任何与此相关的内容,但是,我不知道如何检查以确保。

我正在使用 icc -fopenmp -lnuma 编译它并使用 KMP_AFFINITY=granularity=fine,compact,OMP_NUM_THREADS=80 和运行 numactl -m 0,1 ./numa。我正在使用这种亲和力,因为我认为它执行与 numactl 看到系统相同的分配。这输出:

NUMA test(pgsize=4096)
thread 20: node 0

所以,这个程序说线程 20 在节点 0,但 numactl 说线程 20 在节点 1。为什么?我期待在两者上看到相同的输出。

【问题讨论】:

【参考方案1】:

请求的关联设置compact 会将连续线程放置到同一内核上的相邻硬件线程(超线程)。操作系统 cpu 的编号稍后会为附加的硬件线程编号,因此 cpu 0 和 40 在同一个核心上。映射如下:

tid -> cpu
0 -> 0
1 -> 40
2 -> 1
3 -> 41
...
20 -> 10

您可以通过将,verbose 添加到KMP_AFFINITY 来查看。如果您想要直接映射,您可以使用GOMP_CPU_AFFINITY=0-79 而不是KMP_AFFINITY 设置。这应该可以在正确的 NUMA 节点上获取内存。

【讨论】:

以上是关于numactl 和 move_pages 不匹配的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

move_pages — Linux manual page

通过 move_pages() 查询失败

numactl --membind

numactl:NETLINK示例源码

Mongodb 使用numactl 启动

宋宝华:为什么numactl内存绑定对代码段不起作用