如何将“读者友好”的 sessionInfo() 写入文本文件
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【中文标题】如何将“读者友好”的 sessionInfo() 写入文本文件【英文标题】:How to write a "reader-friendly" sessionInfo() to text file 【发布时间】:2014-03-24 21:43:23 【问题描述】:我想将“sessionInfo()”的输出保存到一个文本文件中。使用“write()”失败,因为“list() 不能由 'cat()' 处理”。然后我用 ascii = T 尝试了“save()”,但生成的文件并没有真正的帮助。
我想在文本文件中输出like this。有什么简单直接的方法吗?
【问题讨论】:
我正在寻找一个可以包含在 R 降价文件 (Rmd) 中并且可以很好地打印到 PDF/html 的选项。通过我的方法,我最终为相关的SO question 提供了答案。 【参考方案1】:将屏幕输出捕获为字符向量并使用writeLines
。
writeLines(capture.output(sessionInfo()), "sessionInfo.txt")
【讨论】:
是的!谢谢——我现在没有 capture.output() 函数。【参考方案2】:‘sink’ diverts R output to a connection.
sink("sessionInfo.txt")
sessionInfo()
sink()
sessionInfo.txt:
R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.0.2 tools_3.0.2
【讨论】:
谢谢!效果也很好。【参考方案3】:您可能希望使用 devtools
包中的 session_info()
。在这种情况下,您可以使用sink()
,如此处的答案之一所述,或者您可以使用以下内容来设置标题并使其更加不言自明(因为print(session_info())
使用message()
来显示标题):
library("devtools")
library("knitr")
my_session_info <- devtools::session_info()
writeLines(text =
paste(sep = "\n", collapse = "",
paste0(rep("-", 80), collapse = ""),
paste(paste0(rep("-", 32), collapse = ""),
"R environment",
paste0(rep("-", 33), collapse = "")),
paste0(rep("-", 80), collapse = ""),
paste(knitr::kable(data.frame(setting = names(my_session_info$platform),
value = as.character(my_session_info$platform))), collapse = "\n"),
paste0(rep("-", 80), collapse = ""),
paste(paste0(rep("-", 35), collapse = ""),
"packages",
paste0(rep("-", 35), collapse = "")),
paste0(rep("-", 80), collapse = ""),
paste(knitr::kable(my_session_info$packages), collapse = "\n")
)
, con = "session_info.txt")
[ p.s 记得library(devtools)
]
【讨论】:
+1 表示devtools::session_info
。它更容易阅读,因为它是按字母顺序排列的。它还有一些不错的附加功能,例如从 github 或 bitbucket 安装的包的提交哈希。【参考方案4】:
如前所述,您可以使用devtools::session_info()
来获取更易于处理的对象。然后我使用yaml::write_yaml()
(或者jsonlite::write_json()
)将对象写入机器可读和人类可读的版本。例如:
library(magrittr)
library(devtools)
library(yaml)
session_info() %>%
write_yaml("./path/to/file.yaml")
【讨论】:
【参考方案5】:好像我们不需要 writeLines(),因为我们可以直接指定输出文件到 capture.output() 函数。
sessionInfo() %>% capture.output(file="session_info.txt")
【讨论】:
以上是关于如何将“读者友好”的 sessionInfo() 写入文本文件的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章