医学图像数据读取部分

Posted 2020-10-30 carels

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最近在做最后的论文部分，其中有最基础的一部分是对数据的读取。

主要是在我读取的时候接触到多重不一样的数据，比如.dicom, nii, rawb数据等

1. raw数据(主要来自brainWeb的影像)

个人做的是医学图像配准，对于医学图像极端渴求。首先我用了brainWeb的数据进行实验，选择的是其中的raw的数据下载。接着就是打开，其实内部都是数字。参考网上的一些代码，打开方式如下：

filename = 't2_icbm_normal_1mm_pn0_rf0.rawb';
fid=fopen(filename);
temp=fread(fid,181*217*181);
images=reshape(temp,181*217,181);%生成图片集数组

image=images(:,m);       
image=reshape(image,181,217) ;        % 其中image就是一张影像。

2. nii的数据

一些比赛中，官方给出的一般都是nii的数据集，为了打开这些数据集，本人使用的识别已经做好的工具Tools for NIfTI (ANALYZE) MR image

%% 读取.nii文件
    x_man = load_nii('.nii')；    %文件名字为.nii的文件，加载进来的不仅有图像本身，还有很多图像的信息
    images = x_man.img            % 获取图像数据

    
%% save_nii(image_mat, '.nii')    % 保存以.nii为后缀，不然的化会给你分开保存，你就获取了.dat后缀的文件

3.dicom的数据读取

filename = '??????????????.dicm';
dicomread(filename);