virtuoso装载大的rdf文件的方法

Posted cooldream2009

tags:

篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了virtuoso装载大的rdf文件的方法相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

本文详细介绍了将一个比较大的rdf文件装载到virtuoso数据库的过程。参考virtuoso网站的文档说明,通过实践,将一个大约4.6G左右的nt文件装载到virtuoso数据库中,用了大概6个多小时。参考网站:http://vos.openlinksw.com/owiki/wiki/VOS/VirtBulkRDFLoader

以下是具体的步骤。

一 准备条件

1 virtuoso的版本要求。Open source version 6.1.3以上或者commercial version 06.02.3129以上,这些版本有大文件装载函数(方法)。

2 在virtuoso.ini中设置参数”DirsAllowed”,设置完成后需要重新启动virtuoso。

参考:http://docs.openlinksw.com/virtuoso/dbadm/

参数设置的格式如下:

DirsAllowed = <path> [, <path>]

DirsDenied = <path> [, <path>]

 

<path> := <absolute_path> or <relative_path>

可以用下面的命令查看,在cmd中,进入bin目录,然后运行isql,可以进入sql命令模式。

SQL> select server_root (), virtuoso_ini_path ();

上面的命令可以查看服务器的工作目录和ini文件名称。

用以下命令查看DirsAllowed参数的情况

SQL> select cfg_item_value (virtuoso_ini_path (), ‘Parameters‘,
‘DirsAllowed‘);

这一步,我没有设置DirsAllowed,通过命令可以查看到vad目录。

3 合理配置virtuoso.ini,保证有足够的内存和其他系统资源。

参考:http://vos.openlinksw.com/owiki/wiki/VOS/VirtRDFPerformanceTuning

主要设置两个参数,NumberOfBuffers 和 MaxDirtyBuffers。不同的系统内存对应设置不同的参数值。

如下表所示:

System RAM

NumberOfBuffers?

MaxDirtyBuffers?

2 GB

170000

130000

4 GB

340000

250000

8 GB

680000

500000

16 GB

1360000

1000000

32 GB

2720000

2000000

48 GB

4000000

3000000

64 GB

5450000

4000000

比如,我的系统是16G内存,就需要把对应的NumberOfBuffers设置为1360000, MaxDirtyBuffers设置为1000000。

4 文件格式要求。

Virtuoso只支持一下格式。

 

.grdf

Geospatial RDF

.nq

N-Quads

.nt

N-Triples

.owl

OWL

.rdf

RDF/XML

.trig

TriG

.ttl

Turtle

.xml

RDF/XML

 

二 大文件加载的过程

1 准备三个文件,放到vad目录(也就是DirsAllowed的目录)。一个是数据源文件,比如my_data.nt,一个是对应的图文件,和数据源文件的名称相同后面加.graph。比如my_data.nt.graph。一个是公共的图文件,用来处理那些没有对应的图文件的数据源文件,名称为global.graph。

标准格式:

<source-file>.<ext>
<source-file>.<ext>.graph
global.graph

举例:

myfile.n3          ;; RDF data
myfile.n3.graph    ;; Contains Graph IRI name into which RDF data from myfile.n3 will be loaded
global.graph       ;; Contains Graph IRI name into which RDF data from any files that do not have a specific graph name file will be loaded

2 把图的标识名(the graph IRI)写到*.graph中。比如,图的标识名为:http://dbpedia.org,把http://dbpedia.org写到*.graph中。

3 注册要加载的文件。使用isql,进入到SQL命令中,运行合适的方法。比如

SQL> ld_dir (‘/path/to/files‘, ‘*.n3‘, ‘http://dbpedia.org‘);

ld_dir() 里面的目录不包括子目录。ld_dir_all() 命令包括所有的子目录。

4 用DB.DBA.load_list来查看注册的数据集装载情况和图标识名正在加载还是已经加载。ll_state字段有三个值:0表示数据集还没有加载;1表示数据集正在加载中;2表示数据集已经加载完成。如下所示

SQL> select * from DB.DBA.load_list;
ll_file               ll_graph        ll_state    ll_started              ll_done                 ll_host    ll_work_time    ll_error
VARCHAR NOT NULL      VARCHAR         INTEGER     TIMESTAMP               TIMESTAMP               INTEGER    INTEGER         VARCHAR
_____________________________________________________________________________________________________________________________
./dump/d1/file1.n3    http://file1    2           2010.10.20 9:21.18 0    2010.10.20 9:21.18 0    0          NULL            NULL
./dump/d2/file2.n3    http://file2    2           2010.10.20 9:21.18 0    2010.10.20 9:21.18 0    0          NULL            NULL
./dump/file.n3        http://file     2           2010.10.20 9:21.18 0    2010.10.20 9:21.18 0    0          NULL            NULL
 
3 Rows. -- 1 msec.
SQL> 

5 最后,通过rdf_loader_run()命令完成大文件数据的加载。

命令如下:

SQL> rdf_loader_run();

该命令执行后,如果文件比较大,会是一个漫长的等待过程,耐心等待,可以先不管他,做其他的工作去吧。

漫长等待之后,如果装载成功,会有一个花费时间的显示。

通过以上操作,就可以完成数据的加载。

 

以上是关于virtuoso装载大的rdf文件的方法的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

用python计算文件行数[装载自http://www.centoscn.com/python/2013/0806/1110.html]

如何读取 RDF 报告文件

virtuoso如何将label名字调用放大

virtuoso f3快捷键用不了怎么办

virtuoso如何dumptf

在 Virtuoso 中使用 Sql Workbench/J 导入具有空数字字段的 csv 文件