R作图函数(转)

Posted 爱笑的生信媛@f

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了R作图函数(转)相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

dev.new()新建画板

plot()绘制点线图,条形图,散点图.
barplot( ) 绘制条形图
dotchart( ) 绘制点图
pie( )绘制饼图.
pair( )绘制散点图阵
boxplot( )绘制箱线图
hist( )绘制直方图
scatterplot3D( )绘制3D散点图.
低级绘图函数:
par() 可以添加很多参数来修改图形
title( ) 添加标题
axis( ) 调整刻度
rug( ) 添加轴密度
grid( ) 添加网格线
abline( ) 添加直线
lines( ) 添加曲线
text( ) 添加标签
legend() 添加图例
它们还有一系列的绘图参数,坐标轴,图例,颜色,性状,大小,空白,布局,非常繁琐,想掌握,花费的时间会非常多,但是很多人直接跳到ggplot的绘图世界了,不想搞那么多底层绘图代码。
但是我看过一个底层R绘图集大成者,就是Combining gene mutation with gene expression data improves outcome prediction in myelodysplastic syndromes文章的作者的github里面有。
 
但是对大部分人来说,生信的绘图,都是有套路的,其实都被别人包装成函数了,做好数据,一个函数就出了所有复杂的图。比如热图,cluster等等

以上是关于R作图函数(转)的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

R语言作图plot函数以及参数设置解析

R语言可视化及作图10--ggplot2的theme函数

R语言可视化及作图2--低级绘图函数

R语言可视化及作图11--图片分面函数和一页多图

R语言系列作图入门示例一

R语言作图之一