R作图函数（转）

Posted 2020-10-14 爱笑的生信媛@f

dev.new()新建画板

plot()绘制点线图,条形图,散点图.

barplot( ) 绘制条形图

dotchart( ) 绘制点图

pie( )绘制饼图.

pair( )绘制散点图阵

boxplot( )绘制箱线图

hist( )绘制直方图

scatterplot3D( )绘制3D散点图.

低级绘图函数:

par()　可以添加很多参数来修改图形

title( )　添加标题

axis( )　调整刻度

rug( )　添加轴密度

grid( )　添加网格线

abline( )　添加直线

lines( )　添加曲线

text( )　添加标签

legend(）　添加图例

它们还有一系列的绘图参数，坐标轴，图例，颜色，性状，大小，空白，布局，非常繁琐，想掌握，花费的时间会非常多，但是很多人直接跳到ggplot的绘图世界了，不想搞那么多底层绘图代码。

但是我看过一个底层R绘图集大成者，就是Combining gene mutation with gene expression data improves outcome prediction in myelodysplastic syndromes文章的作者的github里面有。

 

但是对大部分人来说，生信的绘图，都是有套路的，其实都被别人包装成函数了，做好数据，一个函数就出了所有复杂的图。比如热图，cluster等等