ucsc genome brower的用法和说明

Posted 2020-10-12 一周一paper，一周一技术

官网说明书：http://genome.ucsc.edu/goldenpath/help/hgTracksHelp.html

 

1.genome brower的作用

a,展示任何尺度的基因组片段。比如，想看某条染色体的某个区域的序列。

b,展示某些位置的annotation tracks。比如，你得到一些区域的深度，你想查看下这些区域的深度在染色体上怎么分布的，他们是否有一致性。

annotation tracks展示在基因组坐标的下方。

ucsc自身带有一些annotaton tracks，一半来自已出版的文章，另一半来自其合作者。用户也可以自定义annotation tracks，这边会涉及到tracks的文件格式。

2.genome brower的开始