基因 GO

Posted 2020-10-09 丫头和她的猫

 

利用DAVID简单的进行GO富集度分析（这里只做简单的分析，即看基因是否存在在GO的三个过程里面）

比如我们有一组要分析的基因：TRPV6    CXADR    PROM1    GRAMD2    SOX10    GPRIN2    VANGL2    GRHL1    BCL11A    MROH8（这里用的是关于人的基因名）

首先打开DAVID网页，选择Functional Annotation：

在左边的框里面按提示输入，步骤1，输入你的ID号，这里可以是基因ID，也可以是基因名，或者是其它的，但是如果你是基因名，则在步骤2选择GENE SYMBOL

 

选好后，点提交：

点击确定，就出现下面：

 

选择人类的类型（Homo sapiens）,点击select Species:

点击右边的Gene_Ontology,在GO的三大类中，可以看出在BP中，我们提交的10个基因中有7个在BP中对应有GO Term项。同理还有CC,MF的也可以看出。

本人还在学习当中，如有不对请指出。