一个文本处理的小练习:

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了一个文本处理的小练习:相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

1.有如下一组数据,经处理,希望得到每行60个碱基,每十个碱基一组。

 

1.将上述数据复制到编辑器,利用列模式,删除数字。保存为fa格式的文件

2.删除碱基间的空格并将小写变为大写:

seqkit seq  11.fa  -g -u  >  12.fa

3.指定每行输出的碱基数

seqkit  seq  12.fa  -s  -w  60  -o   13.fa

4.将每行60个碱基分为10个碱基一组,中间以空格隔开

5.然后就是在每行的行尾添加数字,暂时忘记咋做了。

 

以上是关于一个文本处理的小练习:的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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