一个文本处理的小练习:
Posted 爬行的乌龟
tags:
篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了一个文本处理的小练习:相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
1.有如下一组数据,经处理,希望得到每行60个碱基,每十个碱基一组。
1.将上述数据复制到编辑器,利用列模式,删除数字。保存为fa格式的文件
2.删除碱基间的空格并将小写变为大写:
seqkit seq 11.fa -g -u > 12.fa
3.指定每行输出的碱基数
seqkit seq 12.fa -s -w 60 -o 13.fa
4.将每行60个碱基分为10个碱基一组,中间以空格隔开
5.然后就是在每行的行尾添加数字,暂时忘记咋做了。
以上是关于一个文本处理的小练习:的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章