DICOM:docker实现DICOM服务虚拟化
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了DICOM:docker实现DICOM服务虚拟化相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
背景:
docker,是一个开源的应用容器引擎,眼下大多应用在部署和运维领域,然而因为全然使用沙箱机制,相互之间能够看做独立的主机,且自身对资源的需求也十分有限。远远低于虚拟机。甚至非常多时候。能够直接把容器当做应用本身也没有不论什么问题。因此最近正在尝试将docker应用到传统DICOM服务领域。
本文作为该系列开篇,主要记录docker环境配置过程中遇到的奇葩问题,为兴许更复杂、更全面的应用做准备。
docker中安装jdk:
1. 下载docker镜像
#因为docker官方镜像网络不稳定,此处採用时速云的centos镜像来演示
docker pull index.tenxcloud.com/tenxcloud/centos
通过docker images 查看本地下载的镜像(此处使用-a參数罗列出镜像的所有历史,兴许博文会具体介绍docker镜像在本地的存储)。
2. 安装jdk到docker中
(1)首先启动docker镜像,创建容器
#使用-v參数,创建共享文件夹,方便jdk包传入docker容器内部
docker run -d -v /home/dockercluster/Downloads:/home/zssure --privileged=true IMAGE_ID
注:假设须要对/home/zssure文件夹进行拷贝、改动等操作,须要加入–privilleged=true来开启权限
(2)进入docker容器内部
docker exec -ti CONTAINER_ID /bin/bash
(3)安装jdk
进入docker内部。发现时速云的centos镜像是最精简版,缺少非常多经常使用命令。诸如tar、vim、clear等。遇到这样的问题须要使用yum install 安装
#查找命令所在的安装包
yum search COMMAND-NOT-FOUND
#直接安装查找后的包
yum install search-result-package
3. 提交镜像,并重新启动启动
又一次启动刚提交的镜像,直接检測java是否安装。发现之前安装的jdk失效。
须要使用
#刷新环境变量
source /etc/profile
才干使用jdk。
docker环境变量失效问题:
进到镜像里,查看/etc/profile,明明是有的。之前通过ssh进去也是能够启动的,这是为什么呢?
linux的启动过程里。/etc/profile是在用户登录的时候运行。在命令行run的时候可能是不会进行登录操作,所以没有对应的环境变量。
可是我们启动了ssh服务,从远程是通过登录进的系统,这时候就会有环境变量了。
解决方式:
(1)使用docker run中的-e參数。直接传入环境变量
(2)使用Dockfile中的ENV绑定环境变量
FROM centos:latest
ENV JAVA_HOME /usr/local/java/jdk1.8.0_65
ENV JRE_HOME $JAVA_HOME/jre
ENV CLASSPATH .:$JAVA_HOME/lib:$JRE_HOME/lib
ENV PATH $PATH:$JAVA_HOME/bin
方案摘自: How to source /etc/profile and save it in docker?
上述提到的两种方案。第一种非常适合眼下我们遇到的问题。通过本博文已经找到了解决安装jdk须要每次刷新环境变量的问题。兴许会进一步介绍docker的VOLUME数据卷、网络环境等细节,终于实现DICOM服务虚拟化部署。
作者:[email protected]
时间:2015-12-27
以上是关于DICOM:docker实现DICOM服务虚拟化的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
DICOM医学图像处理:Orthanc Plugin SDK实现WADO服务