BioCode读文件夹以发现缺失文件

Posted 2020-09-27 于淼

代码说明：

使用单个蛋白质的txt计算PSSM生成的结果为单个的PSSM文件。

但是由于一些原因（如蛋白质序列过长），会导致一些蛋白质txt文件无法计算出pssm,为了找到这些没有计算出pssm的蛋白质序列，写出一下代码：

import java.io.File;

/*
 * 找到没计算出PSSM的文件，并输出文件名。
 */
public class find_Nullpssm {
    public void searchFile(String Path) {
        int N = 25103;
        int count = 0;
        for (int i = 1; i <= N; i++) {
            String road = Path + i + ".pssm";
            File file = new File(road);
            if (!file.exists()) {// 存在时,返回true1
                System.out.println(i);
                count++;
            }
        }
        System.out.println(count);

    }

    public static void main(String[] args) {
        find_Nullpssm fi = new find_Nullpssm();
        String Path = "E:\\\\experiment--help\\\\linglingbao\\\\pssm\\\\";
        fi.searchFile(Path);
    }

}

 

注：

①：isFile()
public boolean isFile()测试此抽象路径名表示的文件是否是一个标准文件.如果该文件不是一个目录,并且满足其他与系统有关的标准,那么该文件是标准文件.由Java应用程序创建的所有非目录文件一定是标准文件.
返回:当且仅当此抽象路径名表示的文件存在且是一个标准文件时,返回true;否则返回false;
抛出:SecurityException,如果存在安全管理器,且其SecurityManager.checkRead(java.lang.String)方法拒绝对文件进行读访问.

exists()
public boolean exists()测试此抽象路径名表示的文件或目录是否存在.
返回:当且仅当此抽象路径名表示的文件或目录存在时,返回true;否则返回false;
抛出:SecurityException如果存在安全管理器,且其SecurityManager.checkRead(Java.lang.String)方法拒绝对文件或目录进行写访问.