51nod 1565模糊搜索(FFT)
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了51nod 1565模糊搜索(FFT)相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
题目大意就是字符串匹配,不过有一个门限k而已
之前有提到过fft做字符串匹配,这里和之前那种有些许不同
因为只有A,C,G,T四种字符,所以就考虑构造4个01序列
例如,模板串a关于‘A‘的01序列中,1代表这个位置可以匹配,而0则代表不能匹配。
这样构造出4个序列后,再对匹配串b做同样的处理
下面用a[‘A‘]代表a关于‘A‘的01序列,b同理
然后可以知道a[‘A‘][i]&b[‘A‘][i]如果是1则代表可以匹配,如果是0则代表不能匹配。
那么在位置i两个串能否匹配就可以写做
for(x = i ~ i+lenb) ans += a[‘A‘][i]&b[‘A‘][i]
如果ans恰好等于b中‘A‘的个数,那么就说明‘A‘匹配成功,接下来做‘C‘,‘G‘,‘T‘的情况
如果都可以匹配成功,那么这个位置就可以匹配了
如何用fft做这个呢?实际上也很简单
把b串颠倒一下就变成了a[‘A‘][i]&b[‘A‘][lenb-i]
就是一个卷积形式,于是就可以fft了
(测试感觉stl里的complex比较慢,非递归比递归快很多)
#include <iostream> #include <cstdio> #include <cstring> #include <bitset> #include <cmath> #include <complex> using namespace std; const double pi = acos(-1); const int maxn = 800050; int A[4][maxn], B[4][maxn], ANS[maxn]; struct cp { double a,b; cp() { a = b = 0; } cp(double _a, double _b):a(_a), b(_b) {} cp operator+(const cp&y)const { return cp(a+y.a, b+y.b); } cp operator-(const cp&y)const { return cp(a-y.a, b-y.b); } cp operator*(const cp&y)const { return cp(a*y.a-b*y.b,a*y.b+b*y.a); } cp operator!()const { return cp(a,-b); } }; int T[128]; int la, lb, k; char str[maxn]; class FFT { int n, L, R[maxn]; cp a[maxn], b[maxn]; void DFT(cp *a,int n,int f) { for(int i = 0; i < n; i++) if(i < R[i]) swap(a[i], a[R[i]]); for(int i = 1; i < n; i <<= 1) { cp t, x, wn(cos(pi/i), sin(pi*f/i)); for(int j = 0; j < n; j += (i<<1)) { cp w(1, 0); for(int k = 0; k < i; k++,w = w*wn) { x = a[j+k]; t = w*a[j+k+i]; a[j+k] = x+t; a[j+k+i] = x-t; } } } } public: int c[maxn]; FFT() { memset(R, 0, sizeof(R)); } void init(int *A, int *B, int n1, int n2) { memset(a, 0, sizeof(a)); memset(b, 0, sizeof(b)); for(int i = 0; i <= n1; i++) a[i] = cp(A[i], 0); for(int i = 0; i <= n2; i++) b[i] = cp(B[i], 0); n2 += n1; for(n = 1, L = 0; n <= n2; n <<= 1) L++; for(int i = 0; i < n; i++) R[i] = (R[i>>1]>>1)|((i&1)<<(L-1)); } void calc() { DFT(a, n, 1); DFT(b, n, 1); for(int i = 0; i <= n; i++) a[i] = a[i]*b[i]; DFT(a, n, -1); for(int i = 0; i <= n; i++) c[i] = (a[i].a/n + 0.5); } } fft; int main() { cin>>la>>lb>>k; T[‘A‘] = 0; T[‘C‘] = 1; T[‘G‘] = 2; T[‘T‘] = 3; scanf("%s", str); for(int i = 0; i < la; i++) { int ty = T[str[i]]; A[ty][i] = 1; for(int j = i+1; j <= min(i+k, la-1); j++) { if(ty == T[str[j]]) break; A[ty][j] = 1; } for(int j = i-1; j >= max(0, i-k); j--) { if(A[ty][j]) break; A[ty][j] = 1; } } scanf("%s", str); for(int i = 0; i < lb; i++) { int ty = T[str[i]]; B[ty][lb-i-1] = 1; } for(int i = lb-1; i <= la+lb-2; i++) ANS[i] = 1; for(int i = 0; i < 4; i++) { fft.init(A[i], B[i], la, lb); fft.calc(); int t = 0; for(int j = 0; j < lb; j++) if(B[i][j]) t++; for(int j = lb-1; j <= la+lb-2; j++) ANS[j] &= (fft.c[j] == t); } int ans = 0; for(int i = lb-1; i <= la+lb-2; i++) ans += ANS[i]; cout<<ans<<endl; }
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