R语言读取Hive数据表

Posted 2020-09-19

R通过RJDBC包连接Hive

目前Hive集群主要在济阳，我们的权限是可以通过跳板机来访问 HiveServer， 将Hive 中的批量数据读入R环境，并进行后续的模型和算法运算。

1. 登录跳板机后需要首先在Linux下进行配置

从root权限切换到bzsys用户，才能够通过验证读取Hive。首先需要配置Hadoop的临时环境变量CLASSPATH路径

su bzsys export CLASSPATH=$CLASSPATH:/etc/hadoop/conf

2. 下载并安装RJDBC包

Linux下直接运行R的install 函数通常不成功，建议下载预编译的包通过命令行安装，如下载文件 RJDBC_0.2-6.tar.gz (http://www.rforge.net/RJDBC/)

切换到下载包所在的文件夹下，如 /etc/usr/R-patched/packages (替换为自己的目录)，在终端运行R的命令行，完成安装。

R CMD INSTALL RJDBC_0.2-6.tar.gz

3. 进入R环境

library(RJDBC) # 载入RJDBC包 # 设置R连接时类的路径 CLASSPATH，注意一定要引hive/hadoop这三个路径下的所有包才可以通过认证 cp = c(list.files("/usr/lib/hive/lib", pattern = "[.]jar", full.names=TRUE, recursive=TRUE), list.files("/usr/lib/hadoop", pattern = "[.]jar", full.names=TRUE, recursive=TRUE), list.files("/etc/hadoop/conf", full.names=TRUE, recursive=TRUE), recursive=TRUE ) # 新建RJDBC的 Driver drv <- JDBC(driverClass = "org.apache.hive.jdbc.HiveDriver", classPath = cp) # 建立连接Connection # 常见错误: 注意路径是jdbc:hive2:而不是jdbc:hive:, 因为新版Hive启用了 HiveServer2，替代了之前的HiveServer变量 # "hadoop-jy-backupserver:10000" 为济阳集群的URL和默认端口PORT 10000, "principal=" 为需要的特殊认证Authentication hiveconnection <- dbConnect(drv,"jdbc:hive2://hadoop-jy-backupserver:10000/default;principal=hive/[email protected]",user="*******", password="*******")   # *** 替换为相应用户名和密码

4. R操作 Hive数据表范例

library(RJDBC) cp = c(list.files("/usr/lib/hive/lib", pattern = "[.]jar", full.names=TRUE, recursive=TRUE), list.files("/usr/lib/hadoop", pattern = "[.]jar", full.names=TRUE, recursive=TRUE), list.files("/etc/hadoop/conf", full.names=TRUE, recursive=TRUE), recursive=TRUE ) drv = JDBC(driverClass = "org.apache.hive.jdbc.HiveDriver", classPath = cp) hiveconnection = dbConnect(drv,"jdbc:hive2://hadoop-jy-backupserver:10000/default;principal=hive/[email protected]",user="*******", password="*******")   # *** 替换为相应用户名密码   # 从BAIDU_INDEX 表中查询记录的个数，存入DataFrame count = dbGetQuery(hiveconnection,"SELECT count(*) FROM cpr.baidu_index")  # 开始执行MapReduce任务   # 非查询Query的语句,如创建表CREATE, dbSendUpdate 函数执行所有非查询Query的语句 sqlCreateTbl = "CREATE TABLE IF NOT EXISTS cpr.person_correlation_graph_temp(rownames STRING,ibao_person_id_x STRING, ibao_person_id_y STRING,     cor_index DOUBLE,start_date STRING,end_date STRING)" result=dbSendUpdate(hiveconnection,sqlCreateTbl)   # 将数据写入Hive数据库 dfToLoad = data.frame(rownames=c(‘1‘,‘2‘),ibao_person_id_x=c(‘盗墓笔记‘,‘盗墓笔记‘), ibao_person_id_y=c(‘李易峰‘,‘杨洋‘),cor_index=c(0.8900,0.5100)) dbWriteTable(hiveconnection, "cpr.person_correlation_graph", dfToLoad, overwrite=TRUE)   # R中执行其他Hive SQL的函数 dbListTables(hiveconnection, "%qiyu%") df = dbReadTable(hiveConn, "iris")