Ubuntu14下Gamit安装

Posted 2020-08-09 王小会

1：获取root权限（仅针对装好Ubunt后没有修改过root密码的用户，如果修改过密码，但是忘掉了，则请进入单用户模式进行修改）：打开命令行:ctrl+alt+t

输入sudo passwd 然后输入两次密码，这个就是修改好的root密码（再输入密码是屏幕不会有任何反应，所以不要以为键盘坏了或者系统有问题）。

然后在输入su root，紧接着输入修改好的root密码就获取root权限了。

 

2：Gamit安装需要csh（tcsh）环境、 GNU gfortran 4.2编译器和libx11－dev库支持。gfortran是软件推荐使用的编译器。libx11-dev是X11的程序开发库，它提供的lib.h和 libx11.a（libx11.so）是Gamit安装必须用到的两个库文件，主要是为Globk的提供图形库支持。以上三个条件却一不可。

 

ubuntu系统没有csh，默认为bash。因此要先安装csh。

 

ubuntu系统自带了gcc4.2，但是却没有安装gfortran编译器。而你安装时安装程序会调用默认的gfortran编译器，除非你指定gcc为你的编译器。

 

首先，以root身份登录，打开终端，输入

 

apt-get install csh

 

系统自动下载并安装csh，安装完成后在终端输入

 

chsh

 

提示：正在更改 root 的 SHELL

 

请输入新值，或直接敲回车键以使用默认值。然后开始登录 Shell [/bin/bash]:

 

输入命令：

 

/bin/csh

 

修改bash为csh。重新起动ubuntu，并以root身份登录，打开终端，输入

 

# echo $SHELL

 

返回s“/bin/csh”,说明SHELL修改成功。

 

接着输入

 

apt-get install gfortran

 

系统自动下载并安装gfortran。

 

再输入

 

apt-get install libx11-dev

 

系统自动下载并安装libx11-dev库支持。

 

 

3：首先右键将gamit10.6提取到当前文件夹下，然后将gamit10.6复制到/opt文件下，在root权限下用命令：

cp  –r  /home/wanghui(这里是你的用户名)/桌面/10.6  /opt

4：进入文件10.6 :   cd  /opt/10.6给install_software赋执行权限，输入命令：

chmod  777 ./install_software

5:运行安装脚本，输入命令：

./ install_software

这是会提示你输入y/n继续，他是问你目录配置是否正确，这里先不要急着输入，首先看终端中的x11libpath和x11incpath后面有没有显示具体路径，如果有，就不要动，如果没有，就按下n，这时他会再次搜索，当完成后，终端上x11libpath和x11incpath应该就有路径了，这时候他会再次提示你输入y/n。这时不要动，把x11libpath和x11incpath后面的路径拷贝下来存起来，马上就用的到。然后我们来改一点东西：

再按ctrl+alt+t，新开一个终端，输入命令：

cd  /opt/gamit10.6/libraries

进入到这个目录中，输入命令：

sudo gedit Makefile.config

然后就会弹出一个文件编辑器，类似于windows下的记事本，我们需要修改一下三个地方：

第一点，如下图所示：

 

看到#generric……那一行没，记住是改那一行下面的，改其他的无效，改好以后保存一下。

第二点，需要修改gamit的内部参数了，在这里我们只需要将MAXATM改为25即可。如图:

第三点也是最后一点就是修改操作系统的版本号。这个时候，在按一下ctrl+alt+t，新开一个终端，输入命令：

uname -a

可以查看到系统的版本号，如图：

这个图中，操作系统版本号3.0.0-12，我们只取前四位即3001，记住它。把文件往下拉，就能看到OS dependeent blocks字样，一直往下拉，找到for linux from 0.01 to 3.0.0字样，然后我们修改OS_ID Linux 0001 3001，中的0001字样，记住只修改它，把它替换为3001，然后保存关掉。

第四个（一般都是64位），如果你的电脑是32位的，那么就要将该文件中的全部m64改为m32，另外 /opt/10.6/gamit/solve/Makefile.generic该文件中的所有m64也要改为m32。

6：在返回到Linux的那个安装gamit终端中，按y继续安装，中间会让你等很长时间，最后它会问你是否创建gg的链接文件，实际就是windows下的快捷方式，按y确定。

7：配置gamit的命令路径，这一步也很重要，如果没配置好，上面的就都白做了。如果使用csh安装gamit的，则需要在主文件目录下，首先按一下ctrl+h，显示隐藏文件。然后新建一个空白文档，并重命名为.cshrc(带.表示是隐藏文件)，双击那个新建的cshrc文件，复制下面的内容到该文件中：

# /etc/csh.cshrc: system-wide .cshrc file for csh(1) and tcsh(1)
# set prompt
#set prompt = "[`echo [email protected]$cwd`]% "
set history = 50
#set system path
#set path = (. /bin /sbin /etc /usr/bin /usr/sbin /usr/bin/X11 /usr/X11R6/bin)
set path = (. /bin /sbin /etc /usr/bin /usr/sbin)
set path = (/usr/local/bin /usr/local/sbin /usr/local/lib /usr/lib $path)
setenv PATH "/usr/sbin:/sbin:${PATH}"
#setenv MANPATH  /usr/local/man:/usr/X11R6/man
setenv LIBPATH  /usr/lib:/usr/local/lib
#set Gamit/Globk path
set gamitpath = /opt/gg
set path = ($gamitpath/gamit/bin $gamitpath/kf/bin $gamitpath/com $path)
setenv HELP_DIR $gamitpath/help/
setenv _POSIX2_VERSION 199209
#set GMT path
#set gmtpath = /usr/lib/gmt
#set path = ($gmtpath/bin $gmtpath/include $gmtpath/lib $gmtpath/man $gmtpath/share $gmtpath/www $path)
#set path = (/etc/gmt /usr/include/gmt /usr/lib/gmt /usr/share/gmt /usr/share/doc/gmt $path)
#setenv MANPATH  "$gmtpath/man:$MANPATH"
#set full domain for GAMIT shell-scripts used to transfer data (sh_get_nav, sh_get_rinex, #sh_get_orbits, and
#  sh_get_hfiles)
set host = `\hostname | \awk -F. ‘{print $1}‘`
set dom  = `\hostname | \awk -F. ‘{print $2}‘`
if( $dom == ‘‘ ) then
   alias hostname ‘echo $host.mit.edu‘
endif

# set alias
# alias cd  ‘cd \!*; set prompt= ‘[`echo [email protected]$cwd`]%‘‘
alias pwd ‘echo $cwd‘

alias ls  ‘ls --classify‘
alias ll  ‘ls -l‘
alias la  ‘ls -a‘
alias rm  ‘rm -i‘
alias mv  ‘mv -i‘
alias cls ‘clear‘

然后先不要关闭文件，先把set gamitpath=/opt/gamit10.6改成你自己的安装目录，然后保存。回到终端，输入命令：

source ~/.cshrc

然后输入命令：

echo $PATH

如果终端显示的path路径中有gamit路径，那么就表示成功。然后新开一个终端，输入命令：

sh_get_rinex 

若显示command not found则表示安装失败，如果显示一大堆信息，则表示安装成功。

8：

这一段是参考百度上的。

9：如果中间安装失败，直接把安装目录删掉重新安装即可。