CRON没有执行R脚本文件

Posted 2023-01-13

我试图自动运行存储在桌面文件夹（cron_test）上的R中的脚本（test.R）。我在我的mac终端中使用CRON。示例R脚本生成随机数，绘制它们并将它们保存为PDF：

setwd("~/Desktop/cron_test")

pdf("example_plot.pdf", width = 8, height = 8)
plot(rnorm(100))
dev.off()

我的CRON代码尝试每分钟调用一次，但文件夹中没有任何内容：

* * * * * Rscript /Users/username/Desktop/cron_test/test.R

什么都没有产生。我尝试过以下方法：

• 如果我从终端调用它，该文件运行正常，表明代码没有问题： Rscript /Users/username/Desktop/cron_test/test.R
• 我还确保（并仔细检查）该文件的权限具有可执行权限，如qazxsw poi： qazxsw poi
• 我也从这个答案中尝试了另一个提出的解决方案，即创建一个调用R脚本的shell文件。这也行不通。

我收到邮件说明CRON任务已经运行，但我的cron_test文件夹中没有输出。

答案

邮件是否说

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?

如果是这样，请尝试使用chmod 777 /Users/username/Desktop/cron_test/test.R的完整路径。你可以从终端找到这个

/bin/sh: Rscript: command not found

这样做的原因是，与交互式终端相比，您在cron会话中获得的环境要小得多。您可以通过比较输出来检查这一点

Rscript

和cron工作

$ which Rscript

通过计算每个文件中的行数，我们可以看到它们完全不同。

$ /usr/bin/env > env-interactive

特别是cron作业中的shell可执行搜索路径（* * * * * /usr/bin/env > env-cron ）要短得多

$ wc -l env-interactive,cron
      20 env-interactive
       8 env-cron

（使用完整路径$PATH在我的macos High Sierra笔记本电脑上为我工作，并制作了情节。）