在R中读取zip文件而不知道其中的csv文件名

Posted 2021-04-07

我正在尝试读取一个包含1个csv文件的zip文件。

当我知道csv文件名时，它工作得很好，但当我只是尝试单独提取zip文件时，它不起作用。

以下是它的工作原理示例：

zip_file <- abc.zip
csv_file <- abcde.csv

data <- read.table(unz(zip_file,csv_file), skip = 10, header=T, quote="\"", sep=",")

当我尝试仅提取zip文件时，这是不起作用的地方：

read.table(zip_file, skip = 10, nrows=10, header=T, quote="\"", sep=",")

出现错误说：

Error in read.table(attachment_file, skip = 10, nrows = 10, header = T,  : 
  no lines available in input
In addition: Warning messages:
1: In readLines(file, skip) : line 2 appears to contain an embedded nul
2: In readLines(file, skip) : line 3 appears to contain an embedded nul
3: In readLines(file, skip) :
  incomplete final line found on 
'C:\Users\nickk\AppData\Local\Temp\RtmpIrqdl8\file2c9860d62381'

所以这表明肯定存在一个csv文件，因为它在我包含csv文件名时起作用，但是当我只是执行zip文件时，则出现错误。

对于上下文，我不想包含csv文件名的原因是因为我需要每天读取此zip文件，并且csv文件的名称每次都不会更改。所以我的目标是只读取zip文件以绕过它。

谢谢！

答案

为什么不尝试使用unzip查找ZIP存档中的文件名：

zipdf <- unzip(zip_file, list = TRUE)
# the following line assuming the archive has only a single file
csv_file <- zipdf$Name[0]

your_df <- read.table(csv_file, skip = 10, nrows=10, header=T, quote="\"", sep=",")

另一答案

如果您对data.table持开放态度，您可以尝试：

data.table::fread(paste('unzip -cq', zip_file), skip = 10)

• -c：取消压缩，脱颖而出;
• -q：压制unzip印刷的消息;