使用ImageJ从多个ROI获取ImagePlus对象

Posted 2021-04-16

我正在使用ImageJ的Java API，需要根据多个选定的ROI（感兴趣的区域）计算一些数据。

首先，我使用了获得当前ROI Manager的实例

RoiManager roiMng = RoiManager.getInstance();

然后，我通过使用Roi[] rois = roiMng.getRoisAsArray();获得经理的所有投资回报率。

从这里开始，我需要在ROI中获取图像并从中获取一些数据。但是，在ROI上调用getImage（）时，我似乎只能得到Null。

做点什么，

Roi roi = rois[0];
ImagePlus foo = roi.getImage();
int height = foo.getHeight();

在foo.getHeight()行给我'java.lang.NullPointerException'。

任何人都对这里可能发生的事情有任何想法？

谢谢！

答案

你需要在ImagePlus上设置roi。然后，您可以通过调用duplicate（）方法复制活动ROI定义的图像部分。

ImagePlus imp = IJ.getImage(); // get the (current) image from the active/selected window
...
imp.setRoi(rois[0]);
ImagePlus roiImp = imp.duplicate();

这样，您将获得ROI边界框定义的图像。如果设置了ROI，则复制方法或者创建整个图像的副本或roi图像。

如果您不需要像素数据，但需要获得基于ROI的统计数据，您可能需要查看https://imagej.nih.gov/ij/developer/api/ij/ImagePlus.html#getStatistics--和https://imagej.nih.gov/ij/developer/api/ij/gui/Roi.html#getStatistics--

希望有所帮助

费利克斯