Python基础-生物信息:找出基因,生物学家使用字母ACT和G构成的字符串建模一个基因组。
Posted Python莫言
tags:
篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了Python基础-生物信息:找出基因,生物学家使用字母ACT和G构成的字符串建模一个基因组。相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
生物信息:找出基因,生物学家使用字母A、C、T和G构成的字符串建模一个基因组。
一个基因是基因组的子串,它从三元组ATG后开始在三元组TAG、TAA或TGA之前结束。
此外,基因字符串的长度是3的倍数,而且基因不包含三元组ATG、TAG、TAA和TGA。
编写程序提示用户输入一个基因组,然后显示基因组里的所有基因。
如果在输入序列中没有找到基因,那么程序显示“no gene is found”
s=input(‘Please input the Gene String:\r\n‘) endsplit=[‘TAG‘,‘TAA‘,‘TGA‘] if ‘ATG‘ in s: for i in s.split(‘ATG‘): for j in endsplit: if j in i: print(i.split(j)[0], end=‘\t‘) else: print(‘no gene is found‘)
以上是关于Python基础-生物信息:找出基因,生物学家使用字母ACT和G构成的字符串建模一个基因组。的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
干货分享《生信基础+主流编程(perl_linux_python_R等)+视频+科普读物》20G限时免费下载