Learning Notes线性链条件随机场（CRF）原理及实现

Posted 2022-04-06 jfdwd

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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了Learning Notes线性链条件随机场（CRF）原理及实现相关的知识，希望对你有一定的参考价值。

1. 概述
条件随机场（Conditional Random Field, CRF）是概率图模型（Probabilistic Graphical Model）与区分性分类( Discriminative Classification）的一种接合，能够用来对“结构预测”（structured prediction，e.g. 序列标注）问题进行建模。

如图1，论文 [1] 阐释了 CRF 与其他模型之间的关系。

图1. CRF 与其他机器学习模型对比【src】

本文我们重点关注输入结点独立的“线性链条件随机场”（Linear-Chain CRF）（如图2）的原理与实现。线性链 CRF 通过与双向 LSTM（Bi-LSTM）的接合，可以用来建模更一般的线性链 CRF（图3），提高模型的建模能力。

图2. 简单的线性链 CRF【src】

图3. 一般性线性链 CRF【src】

2. CRF 算法
2.1 模型形式化
给定长度为 mm 的序列，以及状态集 SS。对于任意状态序列 (s1,?,sm),si∈S(s1,?,sm),si∈S, 定义其“势”（potential）如下：
ψ(s1,…,sm)=∏i=1mψ(si−1,si,i)
ψ(s1,…,sm)=∏i=1mψ(si−1,si,i)

我们定义 s0s0 为特殊的开始符号 ∗∗。这里对 s,s′∈S,i∈1,…,ms,s′∈S,i∈1,…,m，势函数 ψ(s,s′,i)≥0ψ(s,s′,i)≥0。也即，势函数是非负的，它对序列第 ii 位置发生的 ss 到 s′s′ 的状态转移都给出一个非负值。
根据概率图模型的因子分解理论[1]，我们有：
p(s1,…,sm|x1,…,xm)=ψ(s1,…,sm)∑s′1,…,s′mψ(s′1,…,s′m)
p(s1,…,sm|x1,…,xm)=ψ(s1,…,sm)∑s1′,…,sm′ψ(s1′,…,sm′)
Z=∑s′1,…,s′mψ(s′1,…,s′m)Z=∑s1′,…,sm′ψ(s1′,…,sm′) 为归一化因子。

同 HMM 类似，CRF 也涉及三类基本问题：评估（计算某一序列的似然值）、解码（给定输入，寻找似然最大的序列）及训练（根据数据估计 CRF 的参数），解决这三个问题也都涉及前向算法、后向算法及 Viterbi 算法。

CRF 的势函数类似于概率，只不过没有归一化，因此这里介绍的 CRF 前向算法、Viterbi 算法、后向算法，同 HMM 基本一致。

2.2 前向算法
定义：
α(i,s)=∑s1,…,si−1ψ(s1,…,si−1,s)
α(i,s)=∑s1,…,si−1ψ(s1,…,si−1,s)
表示，以 ss 结尾的长度为 ii 的子序列的势。

显然，α(1,s)=ψ(∗,s1,1)α(1,s)=ψ(∗,s1,1)
根据定义，我们有如下递归关系：
α(i,s)=∑s′∈Sα(i−1,s′)×ψ(s′,s,i)
α(i,s)=∑s′∈Sα(i−1,s′)×ψ(s′,s,i)
归一化因子可以计算如下：
Z=∑s1,…,smψ(s1,…sm)=∑s∈S∑s1,…,sm−1ψ(s1,…sm−1,s)=∑s∈Sα(m,s)
Z=∑s1,…,smψ(s1,…sm)=∑s∈S∑s1,…,sm−1ψ(s1,…sm−1,s)=∑s∈Sα(m,s)
对于给定的序列 (s1,?,sm)(s1,?,sm)，其中条件概率（似然）可以计算：
p(s1,…,sm|x1,…,xm)=∏mi=1ψ(si−1,si,i)∑s∈Sα(m,s)
p(s1,…,sm|x1,…,xm)=∏i=1mψ(si−1,si,i)∑s∈Sα(m,s)
* 通过前向算法，我们解决了评估问题，计算和空间复杂度为 O(m⋅|S|2)O(m⋅|S|2)。*

似然的计算过程中，只涉及乘法和加法，都是可导操作。因此，只需要实现前向操作，我们就可以借具有自动梯度功能的学习库（e.g. pytorch、tensorflow）实现基于最大似然准则的训练。一个基于 pytorch 的 CRF 实现见 repo。

import numpy as np

def forward(psi):
m, V, _ = psi.shape

alpha = np.zeros([m, V])
alpha[0] = psi[0, 0, :] # assume psi[0, 0, :] := psi(*,s,1)

for t in range(1, m):
for i in range(V):
‘‘‘
for k in range(V):
alpha[t, i] += alpha[t - 1, k] * psi[t, k, i]
‘‘‘
alpha[t, i] = np.sum(alpha[t - 1, :] * psi[t, :, i])

return alpha

def pro(seq, psi):
m, V, _ = psi.shape
alpha = forward(psi)

Z = np.sum(alpha[-1])
M = psi[0, 0, seq[0]]
for i in range(1, m):
M *= psi[i, seq[i-1], seq[i]]

p = M / Z
return p

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)

alpha = forward(psi)
p = pro(seq, psi)
print(p)
print(alpha)
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2.69869828108e-08
[[ 1.10026295e+00 2.52187760e+00 1.40997704e+00 1.36407554e+00
1.00201186e+00]
[ 1.27679086e+01 1.03890052e+01 1.44699134e+01 1.15244329e+01
1.52767179e+01]
[ 9.30306192e+01 1.09450375e+02 1.26777728e+02 1.28529576e+02
1.16835669e+02]
[ 9.81861108e+02 8.70384204e+02 9.35531558e+02 7.98228277e+02
9.89225754e+02]
[ 6.89790063e+03 8.71016058e+03 8.84778486e+03 9.21051594e+03
6.56093883e+03]
[ 7.56109978e+04 7.00773298e+04 8.60611103e+04 5.63567069e+04
5.99238226e+04]
[ 6.69236243e+05 6.42107210e+05 7.81638452e+05 6.32533145e+05
5.71122492e+05]
[ 6.62242340e+06 5.24446290e+06 5.54750409e+06 4.68782248e+06
4.49353155e+06]
[ 4.31080734e+07 4.09579660e+07 4.62891972e+07 4.60100937e+07
4.63083098e+07]
[ 2.66620185e+08 4.91942550e+08 4.48597546e+08 3.42214705e+08
4.10510463e+08]]
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2.3 Viterbi 解码
Viterbi 利用动态规划，寻找似然最大的序列。Viterbi 与前向算法非常相似，只是将求和操作替换为最大值操作。

α(j,s)=maxs1,…,sj−1ψ(s1,…,sj−1,s)
α(j,s)=maxs1,…,sj−1ψ(s1,…,sj−1,s)

显然，α(1,s)=ψ(∗,s1,1)α(1,s)=ψ(∗,s1,1)
根据定义，我们有如下递归关系：
α(j,s)=maxs′∈S α(j−1,s′)⋅ψ(s′,s,j)
α(j,s)=maxs′∈S α(j−1,s′)⋅ψ(s′,s,j)
在所有 |s|m|s|m 条可能的序列中，概率最大的路径的未归一化的值为：
maxα(m,s)
maxα(m,s)

沿着前向推导的反方向，可以得到最优的路径，算法复杂度是 O(m⋅|S|2)O(m⋅|S|2)。demo 实现如下：
def viterbi_1(psi):
m, V, _ = psi.shape

alpha = np.zeros([V])
trans = np.ones([m, V]).astype(‘int‘) * -1

alpha[:] = psi[0, 0, :] # assume psi[0, 0, :] := psi(*,s,1)

for t in range(1, m):
next_alpha = np.zeros([V])
for i in range(V):
tmp = alpha * psi[t, :, i]
next_alpha[i] = np.max(tmp)
trans[t, i] = np.argmax(tmp)
alpha = next_alpha

end = np.argmax(alpha)
path = [end]
for t in range(m - 1, 0, -1):
cur = path[-1]
pre = trans[t, cur]
path.append(pre)

return path[::-1]

def viterbi_2(psi):
m, V, _ = psi.shape

alpha = np.zeros([m, V])
alpha[0] = psi[0, 0, :] # assume psi[0, 0, :] := psi(*,s,1)
for t in range(1, m):
for i in range(V):
tmp = alpha[t - 1, :] * psi[t, :, i]
alpha[t, i] = np.max(tmp)

end = np.argmax(alpha[-1])
path = [end]
for t in range(m - 1, 0, -1):
cur = path[-1]
pre = np.argmax(alpha[t - 1] * psi[t, :, cur])
path.append(pre)

return path[::-1]

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative

path_1 = viterbi_1(psi)
path_2 = viterbi_2(psi)
print(path_1)
print(path_2)
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[1, 4, 2, 4, 3, 0, 3, 0, 3, 1]
[1, 4, 2, 4, 3, 0, 3, 0, 3, 1]
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2.4 后向算法
为了训练 CRF, 我们需要计算相应的梯度。为了手动计算梯度（这也为后续优化打开大门），需要用到后向算法。

定义：

β(j,s)=∑sj+1,…,smψ(sj+1,…,sm|sj=s)
β(j,s)=∑sj+1,…,smψ(sj+1,…,sm|sj=s)
其中，令 β(m,s)=1β(m,s)=1。

可以认为序列结尾存在特殊的符号。为简单起见，不讨论结尾边界的特殊性，可以都参考前向边界的处理及参见实现。

根据定义，我们有如下递归关系：

β(j,s)=∑s′∈Sβ(j+1,s′)⋅ψ(s,s′,j+1)
β(j,s)=∑s′∈Sβ(j+1,s′)⋅ψ(s,s′,j+1)
def backward(psi):
m, V, _ = psi.shape

beta = np.zeros([m, V])
beta[-1] = 1

for t in range(m - 2, -1, -1):
for i in range(V):
‘‘‘
for k in range(V):
beta[t, i] += beta[t + 1, k] * psi[t + 1, i, k]
‘‘‘
beta[t, i] = np.sum(beta[t + 1, :] * psi[t + 1, i, :])

return beta

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)

beta = backward(psi)
print(beta)
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[[ 2.95024144e+08 2.61620644e+08 3.16953747e+08 2.02959597e+08
2.51250862e+08]
[ 2.73494359e+07 2.31521489e+07 3.62404054e+07 2.84752625e+07
3.38820012e+07]
[ 2.92799244e+06 3.00539203e+06 4.18174216e+06 3.30814155e+06
3.45104724e+06]
[ 4.40588351e+05 4.18060894e+05 3.95721271e+05 4.50117410e+05
4.38635065e+05]
[ 4.51172884e+04 5.40496888e+04 4.37931199e+04 4.98898498e+04
5.04357771e+04]
[ 6.50740169e+03 5.21859026e+03 5.66773856e+03 4.73895449e+03
5.79578682e+03]
[ 4.83173340e+02 5.36538120e+02 6.01820173e+02 7.07538756e+02
6.54966046e+02]
[ 7.60936291e+01 7.90609361e+01 9.08681883e+01 5.80503199e+01
5.89976569e+01]
[ 8.15414542e+00 7.95904764e+00 9.64664115e+00 8.69502743e+00
9.41073532e+00]
[ 1.00000000e+00 1.00000000e+00 1.00000000e+00 1.00000000e+00
1.00000000e+00]]
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2.5 梯度计算
Z=∑s1,…,smψ(s1,…,sm)=∑s′i−1∈S,s′i∈S∑si−1=s′i−1,si=s′iψ(s1,…,sm)=∑s′i−1∈S,s′i∈Sα(i−1,s′i−1)⋅β(i,s′i)⋅ψ(s′i−1,s′i,i) 1<i≤m
Z=∑s1,…,smψ(s1,…,sm)=∑si−1′∈S,si′∈S∑si−1=si−1′,si=si′ψ(s1,…,sm)=∑si−1′∈S,si′∈Sα(i−1,si−1′)⋅β(i,si′)⋅ψ(si−1′,si′,i) 1<i≤m
对于 i=1i=1 的边界情况：
Z=∑s′1∈Sβ(1,s′i)⋅ψ(∗,s′1,1)
Z=∑s1′∈Sβ(1,si′)⋅ψ(∗,s1′,1)
对于路径 (s1,?,sm)(s1,?,sm)，
p(s1,…,sm|x1,…,xm)=ψ(s1,…,sm)Z=∏mi=1ψ(si−1,si,i)Z=∏mi=1ψisi−1,siZ
p(s1,…,sm|x1,…,xm)=ψ(s1,…,sm)Z=∏i=1mψ(si−1,si,i)Z=∏i=1mψsi−1,siiZ

其中，ψis′,s=ψ(s′,s,i), s′,s∈Sψs′,si=ψ(s′,s,i), s′,s∈S。
记分子 ∏mi=1ψ(si−1,si,i)=M∏i=1mψ(si−1,si,i)=M 则：
∂p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψks′,s=1Z[Mψks′,s⋅δs′=sk−1&s=sk−p⋅α(k−1,s′)⋅β(k,s)]
∂p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψs′,sk=1Z[Mψs′,sk⋅δs′=sk−1&s=sk−p⋅α(k−1,s′)⋅β(k,s)]
其中，δtrue=1,δfalse=0δtrue=1,δfalse=0。

∂lnp(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψks′,s=1p⋅∂p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψks′,s=δs′=sk−1&s=skψks′,s−1Zα(k−1,s′)⋅β(k,s)
∂ln?p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψs′,sk=1p⋅∂p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψs′,sk=δs′=sk−1&s=skψs′,sk−1Zα(k−1,s′)⋅β(k,s)
def gradient(seq, psi):
m, V, _ = psi.shape

grad = np.zeros_like(psi)
alpha = forward(psi)
beta = backward(psi)

Z = np.sum(alpha[-1])

for t in range(1, m):
for i in range(V):
for j in range(V):
grad[t, i, j] = -alpha[t - 1, i] * beta[t, j] / Z

if i == seq[t - 1] and j == seq[t]:
grad[t, i, j] += 1. / psi[t, i, j]

# corner cases
grad[0, 0, :] = -beta[0, :] / Z
grad[0, 0, seq[0]] += 1. / psi[0, 0, seq[0]]

return grad

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)

grad = gradient(seq, psi)
print(grad[0, :, :])
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[[ 0.75834232 -0.13348772 -0.16172055 -0.10355687 -0.12819671]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]]
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def check_grad(seq, psi, i, j, k, toleration=1e-5, delta=1e-10):
m, V, _ = psi.shape

grad_1 = gradient(seq, psi)[i, j, k]

original = psi[i, j, k]

# p1
psi[i, j, k] = original - delta
p1 = np.log(pro(seq, psi))

# p2
psi[i, j, k] = original + delta
p2 = np.log(pro(seq, psi))

psi[i, j, k] = original
grad_2 = (p2 - p1) / (2 * delta)

diff = np.abs(grad_1 - grad_2)
if diff > toleration:
print("%d, %d, %d, %.2e, %.2e, %.2e" % (i, j, k, grad_1, grad_2, diff))

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)
print(seq)

for toleration in [1e-4, 5e-5, 1.5e-5]:
print(toleration)
for i in range(m):
for j in range(V):
for k in range(V):
check_grad(seq, psi, i, j, k, toleration)
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0.0001
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1.5e-05
2, 1, 2, -2.22e-02, -2.22e-02, 1.55e-05
4, 3, 3, -2.03e-02, -2.03e-02, 1.55e-05
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首先定义基本的 log 域加法操作（参见）。

ninf = -np.float(‘inf‘)

def _logsumexp(a, b):
‘‘‘
np.log(np.exp(a) + np.exp(b))

‘‘‘

if a < b:
a, b = b, a

if b == ninf:
return a
else:
return a + np.log(1 + np.exp(b - a))

def logsumexp(*args):
‘‘‘
from scipy.special import logsumexp
logsumexp(args)
‘‘‘
res = args[0]
for e in args[1:]:
res = _logsumexp(res, e)
return res
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def forward_log(log_psi):
m, V, _ = log_psi.shape

log_alpha = np.ones([m, V]) * ninf
log_alpha[0] = log_psi[0, 0, :] # assume psi[0, 0, :] := psi(*,s,1)

for t in range(1, m):
for i in range(V):
for j in range(V):
log_alpha[t, j] = logsumexp(log_alpha[t, j], log_alpha[t - 1, i] + log_psi[t, i, j])

return log_alpha

def pro_log(seq, log_psi):
m, V, _ = log_psi.shape
log_alpha = forward_log(log_psi)

log_Z = logsumexp(*[e for e in log_alpha[-1]])
log_M = log_psi[0, 0, seq[0]]
for i in range(1, m):
log_M = log_M + log_psi[i, seq[i - 1], seq[i]]

log_p = log_M - log_Z
return log_p

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)

alpha = forward(psi)
log_alpha = forward_log(log_psi)
print(np.sum(np.abs(np.log(alpha) - log_alpha)))

p = pro(seq, psi)
log_p = pro_log(seq, log_psi)
print(np.sum(np.abs(np.log(p) - log_p)))
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39
3.03719722983e-14
0.0
1
2
def backward_log(log_psi):
m, V, _ = log_psi.shape

log_beta = np.ones([m, V]) * ninf
log_beta[-1] = 0

for t in range(m - 2, -1, -1):
for i in range(V):
for j in range(V):
log_beta[t, i] = logsumexp(log_beta[t, i], log_beta[t + 1, j] + log_psi[t + 1, i, j])

return log_beta

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)

beta = backward(psi)
log_beta = backward_log(log_psi)

print(np.sum(np.abs(beta - np.exp(log_beta))))
print(np.sum(np.abs(log_beta - np.log(beta))))
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1.46851337579e-06
1.86517468137e-14
1
2
def gradient_log(seq, log_psi):
m, V, _ = log_psi.shape

grad = np.zeros_like(log_psi)
log_alpha = forward_log(log_psi)
log_beta = backward_log(log_psi)

log_Z = logsumexp(*[e for e in log_alpha[-1]])
for t in range(1, m):
for i in range(V):
for j in range(V):
grad[t, i, j] -= np.exp(log_alpha[t - 1, i] + log_beta[t, j] - log_Z)
if i == seq[t - 1] and j == seq[t]:
grad[t, i, j] += np.exp(-log_psi[t, i, j])

# corner cases
grad[0, 0, :] -= np.exp(log_beta[0, :] - log_Z)
grad[0, 0, seq[0]] += np.exp(-log_psi[0, 0, seq[0]])

return grad

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

log_psi = np.random.random([m, V, V])
psi = np.exp(log_psi) # nonnegative
seq = np.random.choice(V, m)

grad_1 = gradient(seq, psi)
grad_2 = gradient_log(seq, log_psi)

print(grad_1[0, :, :])
print(grad_2[0, :, :])
print(np.sum(np.abs(grad_1 - grad_2)))
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[[ 0.75834232 -0.13348772 -0.16172055 -0.10355687 -0.12819671]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]]
[[ 0.75834232 -0.13348772 -0.16172055 -0.10355687 -0.12819671]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]
[ 0. 0. 0. 0. 0. ]]
1.11508025036e-14
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在 log 域，我们一般直接计算目标函数相对与 lnψln?ψ 的梯度计算公式如下：

∂lnp(s1,…,sm|x1,…,xm)∂lnψks′,s=∂lnp(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψks′,s⋅∂ψks′,s∂lnψks′,s=δs′=sk−1&s=sk−exp(lnα(k−1,s′)+lnβ(k,s)−lnZ+lnψks′,s)
∂ln?p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ln?ψs′,sk=∂ln?p(s1,…,sm|x1,…,xm)∂ψs′,sk⋅∂ψs′,sk∂ln?ψs′,sk=δs′=sk−1&s=sk−exp?(ln?α(k−1,s′)+ln?β(k,s)−ln?Z+ln?ψs′,sk)
只需将上面的 grad_log 稍做改动即可，不再赘述。

3. CRF + 人工神经网络
3.1 势函数选择
目前为止，我们都假设函数已经知道，在此基础上推导 CRF 的相关计算。理论上，除了非负性的要求，势函数可以灵活的选择。为也便于计算和训练，CRF 中一般选择指数的形式。假设输入为 x1,…,xmx1,…,xm，则势函数定义为：

ψ(s′,s,i)=exp(w⋅?(x1,…,xm,s′,s,i))
ψ(s′,s,i)=exp?(w⋅?(x1,…,xm,s′,s,i))
则
ψ(s1,…,sm)=∏i=1mψ(si−1,si,i)=∏i=1mexp(w⋅?(x1,…,xm,si−1,si,i))
ψ(s1,…,sm)=∏i=1mψ(si−1,si,i)=∏i=1mexp?(w⋅?(x1,…,xm,si−1,si,i))
其中，?(x1,…,xm,s′,s,i)∈Rd?(x1,…,xm,s′,s,i)∈Rd 是特征向量，w∈Rdw∈Rd 是参数向量。

其中，PP 是 |S|×|S||S|×|S| 的转移矩阵。
如果 x=(x1,?,xm)∈Rmx=(x1,?,xm)∈Rm，则有：

scoree(sj|xi)=Wj⋅xi
scoree(sj|xi)=Wj⋅xi

def score(seq, x, W, P, S):
m = len(seq)
V = len(W)

log_psi = np.zeros([m, V, V])

# corner cases
for i in range(V):
# emit
log_psi[0, 0, i] += S[i]
# transmit
log_psi[0, 0, i] += x[0] * W[i]

for t in range(1, m):
for i in range(V):
for j in range(V):
# emit
log_psi[t, i, j] += x[t] * W[j]
# transmit
log_psi[t, i, j] += P[i, j]

return log_psi

def gradient_param(seq, x, W, P, S):
m = len(seq)
V = len(W)

log_psi = score(seq, x, W, P, S)

grad_psi = gradient_log(seq, log_psi)
grad_log_psi = np.exp(log_psi) * grad_psi

grad_x = np.zeros_like(x)
grad_W = np.zeros_like(W)
grad_P = np.zeros_like(P)
grad_S = np.zeros_like(S)

# corner cases
for i in range(V):
# emit
grad_S[i] += grad_log_psi[0, 0, i]
# transmit
grad_W[i] += grad_log_psi[0, 0, i] * x[0]
grad_x[0] += grad_log_psi[0, 0, i] * W[i]

for t in range(1, m):
for i in range(V):
for j in range(V):
# emit
grad_W[j] += grad_log_psi[t, i, j] * x[t]
grad_x[t] += grad_log_psi[t, i, j] * W[j]
# transmit
grad_P[i, j] += grad_log_psi[t, i, j]

return grad_x, grad_W, grad_P, grad_S

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 7

seq = np.random.choice(V, m)
x = np.random.random(m)
W = np.random.random(V)
P = np.random.random([V, V])
S = np.random.random(V)

grad_x, grad_W, grad_P, grad_S = gradient_param(seq, x, W, P, S)

print(grad_x)
print(grad_W)
print(grad_P)
print(grad_S)
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[ 0.03394788 -0.11666261 0.02592661 0.07931277 0.02549323 0.11371901
0.02198856]
[-0.62291675 -0.38050215 -0.18983737 -0.65300231 1.84625859]
[[-0.34655117 -0.27314013 -0.16800195 -0.28352514 0.73359469]
[-0.22747135 -0.2967193 -0.27009443 -0.2664594 0.87349324]
[-0.27906702 -0.27747362 -0.33689934 -0.18786182 0.82788735]
[-0.2701056 -0.16940564 -0.2624276 -0.29133856 -0.25558298]
[ 0.72105085 0.86080584 0.76931185 -0.2103895 -0.11362927]]
[-0.17736447 -0.21489701 -0.20747999 -0.19735031 0.79709179]
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梯度正确性检验如下：

def check_grad(seq, x, W, P, S, toleration=1e-5, delta=1e-10):
m, V, _ = psi.shape

grad_x, grad_W, grad_P, grad_S = gradient_param(seq, x, W, P, S)

def llk(seq, x, W, P, S):
log_psi = score(seq, x, W, P, S)
spi = np.exp(log_psi)
log_p = np.log(pro(seq, spi))
return log_p

# grad_x
print(‘Check X‘)
for i in range(len(x)):
original = x[i]
grad_1 = grad_x[i]

# p1
x[i] = original - delta
p1 = llk(seq, x, W, P, S)

# p2
x[i] = original + delta
p2 = llk(seq, x, W, P, S)

x[i] = original
grad_2 = (p2 - p1) / (2 * delta)

diff = np.abs(grad_1 - grad_2) / np.abs(grad_2)
if diff > toleration:
print("%d, %.2e, %.2e, %.2e" % (i, grad_1, grad_2, diff))

# grad_W
print(‘Check W‘)
for i in range(len(W)):
original = W[i]
grad_1 = grad_W[i]

# p1
W[i] = original - delta
p1 = llk(seq, x, W, P, S)

# p2
W[i] = original + delta
p2 = llk(seq, x, W, P, S)

W[i] = original
grad_2 = (p2 - p1) / (2 * delta)

diff = np.abs(grad_1 - grad_2) / np.abs(grad_2)
if diff > toleration:
print("%d, %.2e, %.2e, %.2e" % (i, grad_1, grad_2, diff))

# grad_P
print(‘Check P‘)
for i in range(V):
for j in range(V):
original = P[i][j]
grad_1 = grad_P[i][j]

# p1
P[i][j] = original - delta
p1 = llk(seq, x, W, P, S)

# p2
P[i][j] = original + delta
p2 = llk(seq, x, W, P, S)

P[i][j] = original
grad_2 = (p2 - p1) / (2 * delta)

diff = np.abs(grad_1 - grad_2) / np.abs(grad_2)
if diff > toleration:
print("%d, %.2e, %.2e, %.2e" % (i, grad_1, grad_2, diff))

# grad_S
print(‘Check S‘)
for i in range(len(S)):
original = S[i]
grad_1 = grad_S[i]

# p1
S[i] = original - delta
p1 = llk(seq, x, W, P, S)

# p2
S[i] = original + delta
p2 = llk(seq, x, W, P, S)

S[i] = original
grad_2 = (p2 - p1) / (2 * delta)

diff = np.abs(grad_1 - grad_2) / np.abs(grad_2)
if diff > toleration:
print("%d, %.2e, %.2e, %.2e" % (i, grad_1, grad_2, diff))

np.random.seed(1111)
V, m = 5, 10

seq = np.random.choice(V, m)
x = np.random.random(m)
W = np.random.random(V)
P = np.random.random([V, V])
S = np.random.random(V)

check_grad(seq, x, W, P, S)
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Check X
1, 6.75e-02, 6.75e-02, 5.74e-05
2, 5.14e-01, 5.14e-01, 1.47e-05
3, -3.17e-01, -3.17e-01, 1.51e-05
5, -6.42e-02, -6.42e-02, 7.82e-05
8, -4.38e-02, -4.38e-02, 1.08e-04
Check W
0, -6.55e-01, -6.55e-01, 1.13e-05
2, -1.33e-03, -1.33e-03, 3.77e-04
3, 5.88e-02, 5.89e-02, 1.15e-04
Check P
0, -4.50e-01, -4.51e-01, 1.03e-05
0, -2.70e-01, -2.70e-01, 2.53e-05
1, -2.11e-01, -2.11e-01, 3.13e-05
1, -2.35e-01, -2.35e-01, 1.80e-05
2, -2.93e-01, -2.93e-01, 1.76e-05
2, -1.50e-01, -1.50e-01, 2.15e-05
2, -1.72e-01, -1.72e-01, 3.40e-05
2, -3.48e-01, -3.48e-01, 1.02e-05
3, -1.90e-01, -1.90e-01, 3.10e-05
3, -3.60e-01, -3.60e-01, 1.78e-05
4, 5.47e-01, 5.47e-01, 1.50e-05
Check S
0, -2.02e-01, -2.02e-01, 2.13e-05
1, -1.97e-01, -1.97e-01, 1.82e-05
2, -1.05e-01, -1.05e-01, 6.22e-05
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3.2 Bi-LSTM + CRF
CRF 是强大的序列学习准则。配合双向循环神经网络（e.g. Bi-LSTM）的特征表征和学习能力，在许多序列学习任务上都取得了领先的结果[5~7]。

基本模型如下：

图4. Bi-LSTM CRF 模型【src】

Bi-LSTM 对整个输入序列进行特征提取和建模，用非线性的模型建模发射得分；转移得分用另外的 PP 表示，作为 CRF 自身的参数。相对于常规的用于神经网络训练的目标函数，CRF 是带参数的损失函数。

基于 pytorch 的 CRFLoss 实现见 repo 以及[3, 4]，BiLSTM + CRF 的实现应用见[8]。

讨论
CRF 广泛应用于序列标注任务。
由于是区分性模型，因此在分类任务上，CRF 相比 HMM 可能会更高效。
CRF 对于输出之间的关系进行了建模，这不同于直接的 RNN 或 CTC 模型（相应的，CRF 训练和预测的计算量也更大）。
References
Sutton and McCuallum. An Introduction to Conditional Random Fields.
Michael Collins.The Forward-Backward Algorithm.
Pytorch CRF Forward and Viterbi Implementation.
BiLSTM-CRF on PyTorch.
Collobert. Deep Learning for Efficient Discriminative Parsing.
Collobert et al. Natural Language Processing (Almost) from Scratch.
Huang et al. Bidirectional LSTM-CRF Models for Sequence Tagging.
Bi-LSTM-CRF for NLP.
---------------------
作者：MoussaTintin
来源：CSDN
原文：https://blog.csdn.net/JackyTintin/article/details/79261981
版权声明：本文为博主原创文章，转载请附上博文链接！

以上是关于Learning Notes线性链条件随机场（CRF）原理及实现的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章

条件随机场

NLP入门使用CRF++实现命名实体识别(NER)

条件随机场（crf）

条件随机场（CRF）-基础

条件随机场

ML-13-5条件随机场（CRF-Conditional Random Field）