直系同源基因(orthologous gene)和旁系同源基因(paralogous gene)

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了直系同源基因(orthologous gene)和旁系同源基因(paralogous gene)相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

  在进化过程中,新基因通常来自事先存在的基因,新基因的功能从先前基因的功能进化而来。新基因的原材料

来自基因组区域的重复,这种重复可包括一个或多个基因。

  作为物种形成的伴随事件而被重复,并继续保持相同功能的基因,称为直系同源基因(orthologous gene)

新的基因功能可由在单个物种的基因组中发生的重复引起的。在一个基因组内部的重复导致旁系同源基因(paralogous

gene)。  旁系同源基因的一个例子是β珠蛋白基因和α珠蛋白基因。虽然现在这两种基因差别明显,但它们在

序列上的相似性足以清晰地表明,它们起源于一个遥远的共同祖先中的单个基因。因此,β珠蛋白基因和α珠蛋白

基因是旁系同源基因。(让这个讨论更进一步:在任意两个哺乳类物种中,β珠蛋白基因是直系同源基因,α珠蛋白

基因也一样。但是,一个物种中的β珠蛋白基因和另一个物种中的α珠蛋白基因是旁系同源基因。)

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  补充:伴随着功能丢失的旁系同源基因的特化,称为亚功能化(subfunctionalization)。它一般是有优势的,

因为每个特化的基因可不受限制地向其表达范围内的最佳功能化。如下图:

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  下面是具体举例及更详细的区分(同源和同功序列,直系同源和旁系同源序列):

Homology vs. Analogy

 

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orthology vs. paralogy

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补充:异同源序列

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参考资料:

  【1】遗传学:基因和基因组分析(第八版).[美D.L.哈特尔  M.鲁沃洛 著][杨明 译]

  【2】西北农林科技大学庞红侠老师生信课堂PPT

以上是关于直系同源基因(orthologous gene)和旁系同源基因(paralogous gene)的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

直系同源预测方法

KEGG Orthology 数据库简介

COG:直系同源蛋白数据库

Gene Ontology (GO) 注释

DIP|PCN|CoevDB|PID|Y2H|RosettaDock Serve|元基因组学|微生物多样性

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