生物信息基本工具和数据库

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了生物信息基本工具和数据库相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

生物信息的工具和数据库太多,但有一些基础的工具是必须精通的,甚至需要经常翻阅寻找灵感。

 

通用数据库:

UCSC Genome Browser - 基因组的可视化

OMIM - Online Mendelian Inheritance in Man - 研究疾病必备

 

专业数据库汇总:

单细胞数据库汇总

遗传数据库

表观数据库

蛋白数据库: UniProt, PDB, Pfam, CATH, SCOP2

代谢物数据库

 

待整理:

GeneMANIA - gene network, 分析碰到瓶颈了就去里面找找证据。

webgestalt - 无需编程,网络版的GO、KEGG和GSEA分析工具

TCGA

GTEx

GEO

ENCODE

SRA

gnomAD

ARCHS4

clinvar

NONCODE

GO

KEGG

dbSNP

STRING

NCBI

GWASdb

 

omictools - 汇总数据库 收费了

 

我的final model需要整合这些数据库!!!

 

长期收集。。。

以上是关于生物信息基本工具和数据库的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

生信研究内容

《生物信息学》——李霞;;生信概念

电子科技大学生物信息学 重点

生物信息常用数据库

生物多样性优先保护区信息系统

生物信息技术专业怎么样_就业方向_主要学啥