python学习——读取染色体长度（向前一步：通过染色体序列获得长度信息）
Posted caicai2019
tags:
篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了python学习——读取染色体长度（向前一步：通过染色体序列获得长度信息）相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
# 读取fasta
# 解析每条序列的长度
chr1_seq = ‘ATATATATAT‘
chr2_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCG‘
chr3_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT‘
chr4_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG‘
chr5_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT‘
# 求和
total_len = len(chr1_seq) + len(chr2_seq) + len(chr3_seq) + len(chr4_seq) + len(chr5_seq)
# 输出结果
print(total_len)
以上是关于python学习——读取染色体长度（向前一步：通过染色体序列获得长度信息）的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章
python学习——读取染色体长度（七：读取fasta文件）
python学习——读取染色体长度（四：获取最长染色体的编号）
python学习——通过命令行参数根据fasta文件中染色体id提取染色体序列