python学习——读取染色体长度(向前一步:通过染色体序列获得长度信息)

Posted caicai2019

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了python学习——读取染色体长度(向前一步:通过染色体序列获得长度信息)相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

# 读取fasta

# 解析每条序列的长度
chr1_seq = ‘ATATATATAT‘
chr2_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCG‘
chr3_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT‘
chr4_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG‘
chr5_seq = ‘ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT‘

# 求和
total_len = len(chr1_seq) + len(chr2_seq) + len(chr3_seq) + len(chr4_seq) + len(chr5_seq)

# 输出结果
print(total_len)

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