LA 3602 DNA Consensus String （暴力枚举）

Posted 2020-07-17 dwtfukgv

题意：给定m个长度为n的DNA序列，求一个最短的DNA序列，使得总Hamming距离最小。

Hamming距离等于字符不同的位置个数。

析：看到这个题，我的第一感觉是算时间复杂度，好小，没事，完全可以暴力，只要对每个串的同一个位置，

都选出现最多的，如果有一样的选ASIIC码小的（因为要求字典序小）。然后记录最字符和Hamming距离即可。

代码如下：

#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <algorithm>
#include <queue>
#include <vector>

using namespace std;
const int maxn = 1000 + 10;
char s[55][maxn];
char ans[maxn];

int main(){
    int n, T, m, d, mm;  cin >> T;
    while(T--){
        scanf("%d %d", &m, &n);
        for(int i = 0; i < m; ++i)
            scanf("%s", s[i]);

        d = 0;
        for(int i = 0; i < n; ++i){
            int cnta = 0, cntc = 0, cntg = 0, cntt = 0;
            mm = 0;
            for(int j = 0; j < m; ++j){
                if(‘A‘ == s[j][i])  ++cnta;
                else if(‘C‘ == s[j][i])  ++cntc;
                else if(‘G‘ == s[j][i])  ++cntg;
                else if(‘T‘ == s[j][i])  ++cntt;
            }
            mm = max(mm, cnta);  mm = max(mm, cntc);//查找谁最多多
            mm = max(mm, cntg);  mm = max(mm, cntt);
            if(mm == cnta){   ans[i] = ‘A‘;  d += cntc; d += cntg;  d += cntt; }//不同位置加和
            else if(mm == cntc){   ans[i] = ‘C‘;  d += cnta; d += cntg;  d += cntt; }
            else if(mm == cntg){   ans[i] = ‘G‘;  d += cntc; d += cnta;  d += cntt; }
            else if(mm == cntt){   ans[i] = ‘T‘;  d += cntc; d += cntg;  d += cnta; }
        }
        ans[n] = ‘\0‘;//加结束符

        printf("%s\n%d\n", ans, d);
    }
    return 0;
}