charmm学习历程

Posted dengwenhao

tags:

篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了charmm学习历程相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

1,底物的计算,计算其电荷,设置计算方法,读取的电荷一定是esp电荷,guassview可以查看

2,RTF的准备,编辑,细节很重要

3,PRM。这个可以去Charmm的gui网站上去试一下,具体操作访问Youtube的视频教程

4,体系的文件拆分,包括酶、水分子、底物。这些文件都要对齐格式,我就是因为这个错了好多次,每一列空格都要对应

5,修改inp。进行setup计算。查看log文件,出错就要进行修改。遇到没有读某一个PDB的时候就要查看原PDB文件,依次对应。

以上是关于charmm学习历程的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

学习历程(记录大学学习,电子信息科学类)

python学习历程第五天

python学习历程第三天

《软件工程》学习历程1

python学习历程第19天

[Hadoop] Hadoop学习历程 [持续更新中…]