一些关于医学科研的好用网站(转载)

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蛋白表达数据库 HPA:https://www.proteinatlas.org/

GEO2R,针对GEO数据的差异分析的工具:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/

紧接着,GEO,高通量基因表达数据库:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds

GDC,对TCGA数据库及其他数据库数据的整合分析:https://portal.gdc.cancer.gov/

STRING,蛋白相互作用数据库:https://cn.string-db.org/

Hitpredict,蛋白互作:http://www.hitpredict.org/

BioGRID,蛋白互作:https://thebiogrid.org/

HuRI, 人类蛋白互作组数据库:http://www.interactome-atlas.org/

GeneMANIA, 基因间相互作用和功能:https://genemania.org/

IntAct,开源的分子相互作用数据库:https://www.ebi.ac.uk/intact/home

TIMER,肿瘤免疫的在线研究工具:https://cistrome.shinyapps.io/timer/

Metascape, 基因富集分析在线工具:https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1

Genecards, 基因信息库:https://www.genecards.org/

KM-plotter,在线生存分析工具:https://kmplot.com/analysis/

National Genomics Data Cente, 全球生物数据库目录:https://ngdc.cncb.ac.cn/databasecommons/

Ensembl数据库,基因组检索数据库:http://asia.ensembl.org/index.html

BioPlex,293T细胞系系统的蛋白质互作组学数据库:https://bioplex.hms.harvard.edu/

IMEx,各大蛋白质互作数据库的整合查询工具:http://www.imexconsortium.org/

MassIVE,质谱数据:https://massive.ucsd.edu/ProteoSAFe/static/massive.jsp

Pathway Commons,通路数据库:https://www.pathwaycommons.org/

UniProt,蛋白质百科全书:https://www.uniprot.org/

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PrimerBank,顾名思义,PCR引物设计(白嫖)网站:https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/index.html

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SMART,蛋白结构域的数据库:http://smart.embl-heidelberg.de/

Pfam,蛋白质家族数据库:http://pfam.xfam.org/

DepMap, 细胞系基因表达数据:https://depmap.org/portal/

PrognoScan,基因的预后分析(KM):http://dna00.bio.kyutech.ac.jp/PrognoScan/

OncoLnc,TCGA数据的生存分析:http://www.oncolnc.org/

Biomedical Informatics Institute,预后分析:https://bioinfo.henu.edu.cn/GC/GCList.jsp

UbiBrowser,泛素连接酶-底物相互作用数据库:http://ubibrowser.bio-it.cn/ubibrowser_v3/

NetworkAnalyst,基因表达分析工具:https://www.networkanalyst.ca/

ENCORI,RNA相互作用:https://starbase.sysu.edu.cn/ 作者:康老师不是老师 https://www.bilibili.com/read/cv17418519/ 出处:bilibili

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