一些关于医学科研的好用网站（转载）

Posted 2022-09-07 Mario cai

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GEPIA 2: http://gepia2.cancer-pku.cn/#index

仙桃学术：https://www.xiantao.love/       有基础的功能体验，高阶版需钞能力解锁

转录因子数据库 Cistrome DB: http://cistrome.org/db/#/

蛋白表达数据库 HPA：https://www.proteinatlas.org/

GEO2R，针对GEO数据的差异分析的工具：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/

紧接着，GEO，高通量基因表达数据库：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds

GDC，对TCGA数据库及其他数据库数据的整合分析：https://portal.gdc.cancer.gov/

STRING，蛋白相互作用数据库：https://cn.string-db.org/

Hitpredict，蛋白互作：http://www.hitpredict.org/

BioGRID，蛋白互作：https://thebiogrid.org/

HuRI, 人类蛋白互作组数据库：http://www.interactome-atlas.org/

GeneMANIA, 基因间相互作用和功能：https://genemania.org/

IntAct，开源的分子相互作用数据库：https://www.ebi.ac.uk/intact/home

TIMER，肿瘤免疫的在线研究工具：https://cistrome.shinyapps.io/timer/

Metascape, 基因富集分析在线工具：https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1

Genecards, 基因信息库：https://www.genecards.org/

KM-plotter，在线生存分析工具：https://kmplot.com/analysis/

National Genomics Data Cente, 全球生物数据库目录：https://ngdc.cncb.ac.cn/databasecommons/

Ensembl数据库，基因组检索数据库：http://asia.ensembl.org/index.html

BioPlex，293T细胞系系统的蛋白质互作组学数据库：https://bioplex.hms.harvard.edu/

IMEx，各大蛋白质互作数据库的整合查询工具：http://www.imexconsortium.org/

MassIVE，质谱数据：https://massive.ucsd.edu/ProteoSAFe/static/massive.jsp

Pathway Commons，通路数据库：https://www.pathwaycommons.org/

UniProt，蛋白质百科全书：https://www.uniprot.org/

geneontology，GO数据库，dddd，：http://geneontology.org/

ICG，RT-qPCR内参选择标准库：http://icg.big.ac.cn/index.php/Main_Page

PrimerBank，顾名思义，PCR引物设计（白嫖）网站：https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/index.html

Primer3web，PCR引物在线设计：https://primer3.ut.ee/

UALCAN，TCGA数据挖掘网站：http://ualcan.path.uab.edu/index.html

SMART，蛋白结构域的数据库：http://smart.embl-heidelberg.de/

Pfam，蛋白质家族数据库：http://pfam.xfam.org/

DepMap, 细胞系基因表达数据：https://depmap.org/portal/

PrognoScan，基因的预后分析（KM）：http://dna00.bio.kyutech.ac.jp/PrognoScan/

OncoLnc，TCGA数据的生存分析：http://www.oncolnc.org/

Biomedical Informatics Institute，预后分析:https://bioinfo.henu.edu.cn/GC/GCList.jsp

UbiBrowser，泛素连接酶-底物相互作用数据库：http://ubibrowser.bio-it.cn/ubibrowser_v3/

NetworkAnalyst，基因表达分析工具：https://www.networkanalyst.ca/

ENCORI，RNA相互作用：https://starbase.sysu.edu.cn/ 作者：康老师不是老师 https://www.bilibili.com/read/cv17418519/ 出处：bilibili