标题中没有数字：Neo4j导入工具

Posted 2021-05-04

我正在尝试使用Neo4j import工具并遇到以下错误：

显然它不喜欢我的tsne:X标题。这非常奇怪，因为我没有真正改变数据集的结构（除了添加两个新列：DATASET和cellName）我正在导入，之前它工作得很好。 cells.csv看起来像那样：

我检查了tsneX:float和tsneY:float列中的值，但它们看起来很好，它们是浮点数。如果在任何地方都有一些字符串，我希望neo4j至少报告行号。

我正在同时导入多个类似的文件，如下所示：

sudo neo4j-admin import --database = lanersson.db --nodes import / genes.csv --nodes“import / combined / c57bl6_p19 / cells.csv，import / combined / cd1_e165 / cells.csv，import / combined / cd1_p0 / cells.csv，进口/组合/ cd1_p18 / cells.csv，进口/组合/ cd1_p23 / cells.csv，进口/组合/ cd1_p5 / cells.csv，进口/组合/ hgfapgfp_p120 / cells.csv，导入/合并/ hgfapgfp_p132 / cells.csv”

任何建议将不胜感激

答案

发生错误是因为标题应该仅出现在第一个文件中，而不是在我们同时导入多个文件时出现在下一个文件中，因此更改此：

sudo neo4j-admin import --database = lanersson.db --nodes import / genes.csv --nodes“import / combined / c57bl6_p19 / cells.csv，import / combined / cd1_e165 / cells.csv，import / combined / cd1_p0 / cells.csv，进口/组合/ cd1_p18 / cells.csv，进口/组合/ cd1_p23 / cells.csv，进口/组合/ cd1_p5 / cells.csv，进口/组合/ hgfapgfp_p120 / cells.csv，导入/合并/ hgfapgfp_p132 / cells.csv”

至

sudo neo4j-admin import --database = lanersson.db --nodes import / genes.csv --nodes import / combined / c57bl6_p19 / cells.csv --nodes import / combined / cd1_e165 / cells.csv，import / combined / cd1_p0 /cells.csv --nodes import / combined / cd1_p18 / cells.csv --nodes import / combined / cd1_p23 / cells.csv --nodes import / combined / cd1_p5 / cells.csv --nodes import / combined / hgfapgfp_p120 / cells .csv --nodes import / combined / hgfapgfp_p132 / cells.csv

解决了这个问题。因此，我不是导入多个文件，而是分别导入每个文件，因为每个cells.csv都有自己的标题。如果Neo4j提供了一种导入方式而不需要删除所有后续文件中的标题，那将是很好的，因为当我们生成数据输出文件时，标题存在于所有文件中。