将Rcpp头文件导入NAMESPACE中的R包中

Posted 2021-04-28

这是我在R中的第一个程序包，我已经有了有效的程序包，但是我将删除cpp文件中的某些重写功能，因此我将使用单个功能的头文件。

如何将该标头放入包装中？请注意，header.h和header.cpp在程序包的src/目录中#include "header.h"在我使用此功能的.cpp文件中

我尝试使用以下命令修改NAMESPACE文件：

import(myheader) 

但是，当我这样做时：

R CMD INSTALL mypackage 

我收到此错误：

Error: package or namespace load failed for 'mypackage' in namespaceExport(ns, exports):
 undefined exports: myheader

我该如何解决此错误？

答案

正如@RalfStubner在评论中指出的，NAMESPACE文件用于导出和导入R函数和数据。

使用Rcpp的软件包中NAMESPACE文件的主要要求是确保：

1. 包中的单个功能出于注册原因而导入。
   通常使用evalCpp或sourceCpp。
2. 通过useDynLib()提供共享对象的名称，
3. 这是正在构建的
   • R包的名称。

useDynLib()

其中importFrom(Rcpp, sourceCpp)
useDynLib(<PACKAGE_NAME_HERE>, .registration = TRUE)
是不带<PACKAGE_NAME_HERE>的程序包的名称。 
如果您有兴趣使用标头在
R

软件包之间共享代码，请考虑：<>

主要设计模式是使用https://github.com/r-pkg-examples/rcpp-shared-cpp-functions目录放置仅标头的库。然后，在inst/include中将绑定写入库。确保src/和src/Makevars具有：

src/Makevars.win

如果要在同一
R

程序包中的# Register where the header files for the package can be found PKG_CXXFLAGS=-I../inst/include/ 个文件之间共享功能定义，请参阅：.cpp

这避免了单个整体https://github.com/r-pkg-examples/rcpp-headers-src文件，但不允许在导出的[[R

包装器之外的

R包之间共享编译后的代码例程。