CentOS singularity(HPC) 安装以及简单使用
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了CentOS singularity(HPC) 安装以及简单使用相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
参考技术A singularity 官网(V3.4): https://sylabs.io/guides/3.4/user-guide/installation.htmlsingularity 官网(V3.7): https://sylabs.io/guides/3.7/user-guide/installation.html
singularity 官网(V3.8): https://sylabs.io/guides/3.8/user-guide/installation.html
Singularity入门之运行图形应用
要在 Singularity 中运行图形程序需要重新制作一个镜像,使其包含执行图形应用程序需要的环境和程序,这里还是通过 sandbox 的方式来制作一个可以运行图形程序镜像。
首先以 root 身份运行命令创建一个 centos 的 sandbox。
$ sudo singularity -d build --sandbox centos/ docker://centos
如果已经下载过 centos.simg 镜像,也可以通过下面的命令将其转换为一个 sandbox。
$ sudo singularity build --sandbox centos/ centos.simg
用 root 用户以可写的方式运行容器,并安装桌面环境
$ sudo singularity shell --writable centos/
Singularity: Invoking an interactive shell within container...
Singularity centos:~> yum groupinstall -y "GNOME Desktop"
退出容器并制作成镜像文件
$ sudo singularity build centos-gui.simg centos/
测试一下,启动一个gedit界面看看
singularity exec centos/ gedit
以上是关于CentOS singularity(HPC) 安装以及简单使用的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
Error in lm.fit(x, y, offset = offset, singular.ok = singular.ok, ...): singular fit encountered