无法在IBM DSX R环境笔记本电脑上安装CRAN软件包“viridis”，“Hmisc”

Posted 2021-04-11

我正在尝试在IBM DSX上的R Environment Notebook中安装CRAN Hmisc软件包。但它反复失败，出现以下错误：

install.packages('Hmisc')

also installing the dependencies ‘checkmate’, ‘rstudioapi’, ‘Formula’, ‘latticeExtra’, ‘acepack’, ‘gridExtra’, ‘htmlTable’, ‘viridis’

Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘Hmisc’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

我试图单独安装viridis包，但也失败了同样的错误：

install.packages('viridis')

Warning message in install.packages("viridis"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

答案

我做的是使用devtools下载一个版本的库：

require(devtools)
install_version('Hmisc',  version = "4.1-0")

然后我再次安装它：

install.package('Hmisc')

然后，您可以加载库library('Hmisc')并运行sessionInfo()以查看您运行的是最新版本。这是一种解决方法，我不知道为什么它最初不想安装。也许它与使用版本3.3.2的DSX中的R有关，并且缺少一些库？我没有任何线索。

另一答案

结果是对viridis的错误依赖管理。它依赖于viridisLite >= 0.2.0。最新的viridis期待一个名为cividis的对象，该对象仅在最新版本的viridisLite > 0.2.0上添加。 DSX已经安装了viridisLite==0.2.0。因此，viridis的安装失败。所以基本上，明确安装较新版本的viridisLite解决了这个问题。

install.packages(c('viridisLite', 'Hmisc'))

TL; DR - 安装最新的viridisLite，然后安装Hmisc