Docker / bin / sh：1 ::找不到miniconda3

Posted 2021-04-10

当我尝试使用命令行docker build -t my-image-name .构建以下Dockerfile时

FROM continuumio/miniconda3
EXPOSE 8880

# Set working directory
WORKDIR /my-workingdir

# Add scripts to docker workdir
ADD Dockerfile .
ADD environment.yml .
ADD all-my-python-files.py .

# Update & installation of linux packages
RUN apt-get update -y && 
    apt-get install -y libgl1-mesa-glx apt-utils && 
    apt-get install -y openssh-server && 
    apt-get install -y net-tools
# Conda update and creation of environment
RUN conda update conda 
    && conda env create -f environment.yml 
# Activation of environment
    && echo "source activate environment" > ~/.bashrc

# Mount volumes
VOLUME /my-workingdir/Input

CMD ["python" , "execute_given_python_file.py"]

我在构建时遇到错误：/bin/sh: 1:  : not found我在macOS Hihg Sierra版本10.13.6中构建图像但是当我在linux CentOS环境中构建图像时（在另一个Docker容器内），Dockerfile运行完美。我在mac上使用的Docker版本是

• 客户： 版本：18.06.1-这个 API版本：1.38
• 服务器： 发动机： 版本：18.06.1-ce API版本：1.38（最低版本1.12）

我尝试过以下方法：

1. 在mac上重新安装Docker
2. apt-get update（没有-y）
3. sudo apt-get update
4. 不要更新
5. 不要创建conda环境
6. 不要CMD

但我仍然得到错误。如何解决问题？

更新：在构建映像期间出现错误消息之前的最后一行是：

获取：6 http://security.debian.org/debian-security stretch / updates / main amd64软件包[490 kB]获得：7 http://deb.debian.org/debian stretch-updates / main amd64软件包[5476 B]获取：8 http://deb.debian.org/debian stretch / main amd64软件包[9500 kB]获取10.3 MB in 2s（4564 kB / s）读取包列表... / bin / sh：1 ::找不到

Docker返回非零代码：127

为了复制错误，我包括一个python脚本和一个yml环境。

错误期间测试的Python脚本all-my-python-files.py：

# Name of file: all-my-python-files.py
import openpyxl
import requests
import datetime as dt
import time 
from pandas.io.json import json_normalize
import argparse
import os
import pandas as pd
print("At this point, libraries should be imported")
print("End of python script")

environment.yml文件是：

name: environment
channels:
  - statiskit
  - anaconda
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - asn1crypto=0.24.0
  # For space the following line are not separated into single lines:

- cffi = 1.11.5 - chardet = 3.0.4 - cryptography = 2.3.1 - et_xmlfile = 1.0.1 - idna = 2.7 - jdcal = 1.4 - openpyxl = 2.5.5 - pycparser = 2.18 - pyopenssl = 18.0.0 - pysocks = 1.6.8 - 请求= 2.19.1 - urllib3 = 1.23 - ca-certificates = 2018.8.24 - openssl = 1.0.2p - time = 1.7 - blas = 1.0 - certifi = 2018.8.24 - intel-openmp = 2018.0.3 - libedit = 3.1.20170329 - libffi = 3.2.1＃ - libgfortran = 3.0.1＃未在linux中运行 - mkl = 2018.0.3 - mkl_fft = 1.0.4 - mkl_random = 1.0.1 - ncurses = 6.1 - numpy = 1.15 .1 - numpy-base = 1.15.1 - pandas = 0.23.4 - pip = 10.0.1 - python = 3.7.0 - python-dateutil = 2.7.3 - pytz = 2018.5 - readline = 7.0 - setuptools = 40.2.0 - six = 1.11.0 - sqlite = 3.24.0 - tk = 8.6.8 - wheel = 0.31.1 - xz = 5.2.4 - zlib = 1.2.11＃ - libcxx = 4.0.1＃不在linux中运行＃ - libcxxabi = 4.0.1＃未在linux中运行 - pip： - datetime == 4.2 - zope.interface == 4.5.0前缀：/ Users / Elias / miniconda3 / envs / xlshp

答案

正如@Charler Duffy所提到的，这个问题与脚本中不可见的行尾相关。不知何故，以下列方式编写代码解决了这个问题：

RUN apt-get update
RUN apt-get install -y libgl1-mesa-glx apt-utils openssh-server net-tools
# Conda update and creation of environment
RUN conda update conda && 
    conda env create -f environment.yml && 
    # Activation of environment and correction of bash
    echo "source activate xlshp_env" > ~/.bash

因此，当所有Linux软件包都安装在同一行中时，Dockerfile可以构建映像。