从第二列的开头删除空格

Posted 2021-04-05

我有一个空格分隔的文件，看起来像：

12  12.57428314.57490104 ENSG00000065361 rs2271194 rs61939899
2  2.198148577.198835577 ENSG00000065413 rs4524134 rs2697288 rs6738721
6  6.84279922.84407274 ENSG00000065609 rs2016358 rs35791305
10  10.104585135.104956335 ENSG00000065613 rs72811696

我想从第二列中删除前导空格（有两个空格分隔第1列和第2列而不是一个空格）。有没有人知道这个sed或awk命令？

答案

随着削减：

cut -d " " -f 1,3- file

输出：

12 12.57428314.57490104 ENSG00000065361 rs2271194 rs61939899
2 2.198148577.198835577 ENSG00000065413 rs4524134 rs2697288 rs6738721
6 6.84279922.84407274 ENSG00000065609 rs2016358 rs35791305
10 10.104585135.104956335 ENSG00000065613 rs72811696

另一答案

tr -s（或tr --squeeze-repeats）将删除重复的字符。所以如果你想要替换所有重复的空格，你可以写：

tr -s ' '   < input-file   > output-file

输入：

12  12.57428314.57490104 ENSG00000065361 rs2271194 rs61939899
2  2.198148577.198835577 ENSG00000065413 rs4524134 rs2697288 rs6738721
6  6.84279922.84407274 ENSG00000065609 rs2016358 rs35791305
10  10.104585135.104956335 ENSG00000065613 rs72811696

输出：

12.57428314.57490104 ENSG00000065361 rs2271194 rs61939899
2 2.198148577.198835577 ENSG00000065413 rs4524134 rs2697288 rs6738721
6 6.84279922.84407274 ENSG00000065609 rs2016358 rs35791305
10 10.104585135.104956335 ENSG00000065613 rs72811696

另一答案

此AWK用单个空格替换所有出现的连续空格：

$ awk 'gsub(/ +/," ")' file 
12 12.57428314.57490104 ENSG00000065361 rs2271194 rs61939899
2 2.198148577.198835577 ENSG00000065413 rs4524134 rs2697288 rs6738721
6 6.84279922.84407274 ENSG00000065609 rs2016358 rs35791305
10 10.104585135.104956335 ENSG00000065613 rs72811696

另一答案

只需删除每行的第一个空格：

$ sed 's/ //' file
12 12.57428314.57490104 ENSG00000065361 rs2271194 rs61939899
2 2.198148577.198835577 ENSG00000065413 rs4524134 rs2697288 rs6738721
6 6.84279922.84407274 ENSG00000065609 rs2016358 rs35791305
10 10.104585135.104956335 ENSG00000065613 rs72811696

另一答案

使用GNU sed，在第一列之后用单个空格替换多个空格字符

sed -E 's/^(S+)s+/1 /' ip.txt

对于其他版本，请使用

• [[:space:]]为s
• [^[:space:]]为S

或:blank:（空格和制表符）而不是:space:（空白字符）