使用r自动选择.csv文件中的行和列

Posted 2021-04-01

所以我为我的论文创建了一个数据库，我想比较不同情况下的物质来获得P值。为了做到这一点，我在R中创建了一个不自动的脚本。我对如何使用for循环创建一个脚本来执行此操作非常感兴趣。我想为每一行选择组，但也要为每三列选择组。

如果可能，请告诉我。提前致谢！

现在我这样做。首先选择第1行前三个值，然后在第一行选择接下来的三个值，以便在下一步中比较它们。

row1_1 <- my_data[1, 2:4]
row1_2 <- my_data[1, 6:8]

答案

根据问题，以下将使用for循环遍历每一行

for (i in 1:nrow(my_data))
{

case1<- my_data[i, 2:4]
case2<- my_data[i, 6:8]
compare_cases <- t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) 
print(case1)
print(case2)
print(compare_cases)
}

根据注释修改了错误处理的变体

pvalues <- c()
for (i in 1:nrow(my_data))
{

  case1<- my_data[i, 2:4]
  case2<- my_data[i, 6:8]
  pval <- NA
  test <- tryCatch({ t.test(case1, case2, alternative = "two.sided", var.equal = FALSE) }, 
                     warning = function(war) { NA },
                     error = function(err) { NA },
                     finally = { })
  print(paste0("Test for row i=",i))
  print(test)
  if (identical(test,NA)) pval <- NA
  else pval <- test$p.value

  pvalues <- c(pvalues,pval)
}

print("All my pvalues for all rows are:")
print(pvalues)