需要帮助让bash / batch在Windows 10上为R工作

Posted 2021-03-26

我正在尝试在Windows 10上为R工作批处理模式。最终目标是在外部服务器上批量运行一些R代码的迭代。

我在cmd提示符下成功安装了bash（windows 10的unix包装器吗？）。我正在编写一个关于使用批处理的教程。我不确定我是否希望通过cmd或r代码直接运行？ https://github.com/gastonstat/tutorial-R-noninteractive/blob/master/02-batch-mode.Rmd

通过本教程，我正在使用简单的代码myscript1.R来测试batch / bash。然后我输入cmd提示/ bash的代码如下：

R CMD BATCH "F:/Google Drive/Documents/batch/myscript1.R" "F:/Google Drive/Documents/batch/myscript1-output.R"

目前我在cmd / bash中最接近的是输出文件在右侧文件夹中创建但是空白，我被告知 usr lib R bin BATCH：无法创建myscript1-output.R：权限被拒绝。

我已尽一切可能允许所有用户获得完全权限，但不确定发生了什么。任何知道如何在R for Windows中使用批处理模式或bash的人都可以告诉我吗？

谢谢

答案

在这里回答感谢Phil。我不需要通过Ubuntu使用“Bash”......我想。

相反，我只需要通过常规cmd调用CMD BATCH，其中包含三个部分：

1. 我的R.exe目录：“C： Program Files R R-3.5.3 bin x64 R.exe”（替换版本）
2. CMD批次
3. 项目文件/脚本的目录：“F： project_folders_batch myscript1.R”
4. 所需输出的目录（因此它不默认为C / users / username）。在这种情况下，我输出到与脚本相同的文件夹：“F： project_folders_batch myscript1-output.R”

此外，如果您正在输出绘图或任何内容（我是），请在执行此操作之前先将cd（更改目录）添加到项目文件夹。最终结果分为两步：

1. cd / d“F： projectfolder batch”
2. “C： Program Files R R-3.5.3 bin x64 R.exe”CMD BATCH“F： projectfolder batch myscript1.R”“F： projectfolder batch myscript1-output.R “

还要注意你的防病毒软件......它阻止了几次访问。