gene ID，gene symbole，EnsembleID

Posted 2021-03-26 zypiner

gene symbol： TP53

gene ID：7157。Entrez Gene ID，它是目前国际上最权威的Gene ID编号！

 

HGNC（人类基因命名委员会）只对人类基因进行命名。

HUGO Gene Symbol：HUGO Gene Symbol(也叫做HGNC Symbol，即基因符号)是HGNC组织对基因进行命名描述的一个缩写标识符（如:TP53），这些基因符号都是唯一的。

Gene Name：Gene Name是经过HGNC批准的全基因名称;对应于上面批准的符号（Gene Symbol）。例如TP53对应的Gene Name就是：tumor protein p53 。

HGNC ID：HGNC ID是HGNC数据库分配的基因编号，每一个标准的Symbol都有对应的HGNC ID 。我们可以用这个编号，在HGNC数据库中搜索相关的基因。例如：HGNC:11998 有时候HGNC会对一些已经命名过的基因进行重新审查和重新命名，以确保新的基因命名在描述基因功能方面更加的准确。当一个基因被HGNC分配了新的Gene Symbol时，它之前的命名，会被当作同义词继续使用，所以一般建议使用HGNC ID而不是HGNC Symbol来作为我们处理数据中的唯一标识符。

 

EnsembleID：

Ensembl:ENSG00000141510 即Ensembl数据库的ID编号，MIM:191170是来源于OMIM数据库（Online Mendelian Inheritance in Man ,人类孟德尔遗传在线数据库）的编号。Vega:OTTHUMG00000162125来自Vega数据库（Vertebrate Genome Annotation，脊椎动物基因组注释 ）

 

NCBI的GenBank：

NCBI核酸序列数据库-GenBank

 

 

参考资料：https://cloud.tencent.com/developer/article/1358527