十ITK例程-医疗图像配准的HelloWorld程序

Posted 2021-03-21 fantianliang

一、说明

　　医疗图像配准是ITK的一个重要内容，而我们今天想要说的一个程序则相当于是其中的HelloWorld程序。

　　程序源码位置：

InsightToolkit-5.0.1ExamplesRegistrationITKv4ImageRegistration1.cxx

 二、ITK的配准框架

　　

三、程序的主要思路

　　程序的主要思路可以用如下的框图来表示：

　　

　　其中我们需要输入输出的文件如下：

　　

 

 　　但是在这里，为了便于程序阅读，这个时候我把所有的参数全部都写在了程序里面。

四、工程构建

　1-构建工程

　　按照之前的方法，利用已经有的源文件构建一个工程，并且添加属性表和动态链接库文件。

　2-程序修改

　　源码程序这个时候不是能用的，需要稍作修改

　 2.1将每一个argv参数的位置直接修改为文件名

　　参数含义如下：

参数	内容
argv[1]	参考图片
argv[2]	待配准图片
argv[3]	输出待配准图片（以参考图片格式输出）
argv[4]	两个输入图片配准之后的差值图片
argv[5]	两个输入图片未配准的时候的差值图片

 　　实际程序里面修改：

//参考图片位置
fixedImageReader->SetFileName("D:FilesSetupITKInsightToolkit-5.0.1ExamplesDataBrainProtonDensitySliceBorder20.png");
//待配准图片位置
movingImageReader->SetFileName("D:FilesSetupITKInsightToolkit-5.0.1ExamplesDataBrainProtonDensitySliceShifted13x17y.png");
//文件写入位置，这三张图片全部都写入到本工程目录下
writer->SetFileName("D:FilesITKFilesITK_6_RegistrationDataOutputDataMoving13x17yInputType.png");
writer2->SetFileName("D:FilesITKFilesITK_6_RegistrationDataOutputDataMoving13x17yInputType.png");
writer2->SetFileName("D:FilesITKFilesITK_6_RegistrationDataOutputDataDifferenceBeforeRegistration.png");

　　2.2添加头文件

　　因为要阅读png文件，所以需要添加png文件的IOFactory

#include "itkPNGImageIOFactory.h"

　　初始化IOFactory:

itk::PNGImageIOFactory::RegisterOneFactory();

　　2.3添加命令行参数

　　因为程序里面有对输入参数的判断，当我们修改以后，还是要满足输入参数的个数（虽然我们已经不用这个参数了，但是这个判断条件是程序运行的触发条件）

　　打开调试-属性：

　　

 

　　 在调试-命令参数里面输入六个随意数字，以空格间隔：

　

 五、运行结果

　　得到的几张图片与参考书吻合：

　　

 

      控制台输出如下：

　　

 

     可以看到，一共经过了36次迭代，最后计算出来的测度函数值为0.0007,然后得到的偏移量是(13,17),和图片的真实偏移量是符合的

六、参考

　　InsightSoftwareGuide-Book2-5.0.1 Page189(书籍页码)

七、问题

　　今天出了一个糗事，我在构建工程的时候，由于偷懒，直接复制的另外一个工程，然后程序都已经修改好了，不论怎么运行，都没有输出。

　　还以为是函数复制出了问题，但是这个时候我才发现，我根本没有把这个main.cpp文件添加到工程里面。

　　害的我特地对比了一下是不是函数复制的时候出了问题。

　　......

　　不注重细节害死人啊。