是否可以使用tbl_regression fonction与lmer fonction的随机效应？

Posted 2021-03-19

我的工作是研究与杀菌剂一起添加的一些分子（"环"）的抗真菌活性，我想评估这些环的影响及其浓度比。CMI是一个定量变量，所有其他变量都是因素。

我有这个脚本。

mod=lmer(CMI ~ cyclo*ratio + (1|fungicide) + (1|strains), data)

我想知道我是否可以使用... ... tbl_regression() (library(gtsummary))与我的 lmer()?

如果是，我需要为指数项指定什么？如果我写 exponentiate=FALSE 我得到的数值与经典的估计值相同。summary(mod).

谢谢你的帮助

Steffi

答案

默认行为 tbl_regression() 是为了只打印固定效应模型。要查看完整的输出，包括随机成分，您需要覆盖默认的功能，使用 tidy_fun= 参数。

library(gtsummary)

lme4::lmer(age ~ marker + (1|grade), trial) %>%
  tbl_regression(
    # set the tidying function to broom.mixed::tidy to show random effects
    tidy_fun = broom.mixed::tidy,
  )

您可以使用 label= 参数来更新随机组件的标签。

默认值是 exponentiate = FALSE，所以你不需要在 tbl_regression() 呼叫。

更多关于 tidy_fun= 参数，你可以查看这个帮助文件。http:/www.danieldsjoberg.comgtsummaryreferencevetted_models.html

希望能帮到你! 编码快乐!