SimpleITK中术语

Posted 2021-03-04 dyc99

在SimpleITK中，各术语对应如下：

Width: 宽度，X轴，矢状面
Height: 高度，Y轴，冠状面
Depth: 深度， Z轴，横断面

引用自：https://blog.csdn.net/JianJuly/article/details/99547691

GetArrayFromImage()可用于将SimpleITK对象转换为ndarray

import SimpleITK as sitk
# 实验用的图片大小为320*250*80，
# 即矢状面（x轴方向）切片数为320，冠状面（y轴方向）切片数为250，
# 横断面（z轴方向）片数为80 
# 如上图所示

path = ‘E:COVID-19CTimageAnallabel0018.dcm‘
image = sitk.ReadImage(path)# convert to ndarry
data = sitk.GetArrayFromImage(image)
shape_data = data.shape
print(f‘shape of data: {shape_data}‘)

输出：

shape of data: (80, 250, 320)

原始SimpleITK数据的存储形式为(Width, Height, Depth)即（X，Y，Z），使用GetArrayFromImage()方法后，X轴与Z轴发生了对调，输出形状为：(Depth, Height, Width)即（Z,Y,X）。