DNA和RNA测序之间有什么区别?
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DNA测序(同义词:DNA深度测序| DNA高通量测序)包括全基因组测序(WGS),全外显子组测序(WES或WXS)和靶向测序。
WGS意味着对整个DNA基因组进行测序,
而WES专注于mRNA编码区(外显子)进行测序,而mRNA编码区(外显子)通常只占很小的基因组部分(在人类中为3%)。
尽管WGS和WES都可以用来发现与疾病或表型相关的罕见突变/常见变异,但WES的价格却比WGS便宜得多且速度更快。
靶向测序仅关注目标基因(或目标区域)的子集,是最快,最便宜的DNA测序类型。
RNA测序(同义词:RNA深度测序| RNA高通量测序)
包括全转录组测序(WTS),mRNA测序(mRNA-seq)和小RNA测序(smRNA-seq)。
与DNA-seq不同,RNA-seq需要先将提取的RNA反转录为cDNA,然后再进行扩增。
RNA测序最常见的应用是检测基因表达的变化,可变剪接,转录后修饰,基因融合,也可以检测突变和SNP。
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