annvar下载数据库的网址
Posted ywliao
tags:
篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了annvar下载数据库的网址相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
背景
因为annovar默认的脚本下载数据库，总是中断，所以我选择用wget 下载
方法
比如想下载hg19_gwava数据，那么需要下载原始txt数据和idx文件，路径如下
http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_gwava.txt.gz
http://www.openbioinformatics.org/annovar/download/hg19_gwava.txt.idx.gz
下载之后再解压就好了，像refGene（没有idx文件)这些都可以参照上面的下载下载
最后附上annovar可以下载的数据库的名称说明：https://annovar.readthedocs.io/en/latest/user-guide/download/
以上是关于annvar下载数据库的网址的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章
Python下载Wyoming怀俄明大学探空数据（数据网址更新）