二代测序技术总结
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了二代测序技术总结相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
二代测序技术比较:
公司 |
平台名称 |
测序方法 |
检测方法 |
读长(bp) |
优点 |
相对局限性 |
罗氏/454 |
基因组测序仪FLX系统 |
焦磷酸测序法 |
光学 |
230-400 |
二代测序中读长最长;比一代测序通量要大 |
样品制备较难;难于处理重复和同种碱基多聚区域;试剂冲洗带来错误累积;仪器昂贵; |
Illumina |
HiSeq2000(4000)/Miseq |
SBS |
荧光/光学
|
2x(150-300) |
很高测序通量; |
仪器昂贵;用于书记胡删节和分析的费用很高 |
ABL/SOLiD |
5500x|SOLID系统 |
连接测序法 |
荧光/光学 |
25-35 |
高通量测序,二代测序平台中,拼接人类基因组的试剂成本最低 |
测序运行时间长;读长短,造成成本高,数据分析、拼接困难;仪器昂贵 |
Life Technology |
PGM/Proton |
SBS |
以离子敏感场效应晶体管验测PH值变化 |
100-200 |
对核酸碱基的参入可直接测定;在自然条件下进行DNA合成(不需使用修饰过的碱基) |
一步步洗脱过程导致错误累积;阅读高重复和同种多聚序列时有潜在困难 |
Complete Genomics |
Blackbird |
cPAL |
荧光/光学 |
100 |
通量高;成本低;单测序步骤独立,使错误累积最低 |
低读长;模板制备妨碍长重复序列区域测序;样品制备费事 |
以上是关于二代测序技术总结的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章