二代测序技术总结

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了二代测序技术总结相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

二代测序技术比较:

公司

平台名称

测序方法

检测方法

读长(bp)

优点

相对局限性

罗氏/454

基因组测序仪FLX系统

焦磷酸测序法

光学

230-400

二代测序中读长最长;比一代测序通量要大

样品制备较难;难于处理重复和同种碱基多聚区域;试剂冲洗带来错误累积;仪器昂贵;

Illumina

HiSeq2000(4000)/Miseq

SBS

荧光/光学

 

2x(150-300)

很高测序通量;

仪器昂贵;用于书记胡删节和分析的费用很高

ABL/SOLiD

5500x|SOLID系统

连接测序法

荧光/光学

25-35

高通量测序,二代测序平台中,拼接人类基因组的试剂成本最低

测序运行时间长;读长短,造成成本高,数据分析、拼接困难;仪器昂贵

Life Technology

PGM/Proton

SBS

以离子敏感场效应晶体管验测PH值变化

100-200

对核酸碱基的参入可直接测定;在自然条件下进行DNA合成(不需使用修饰过的碱基)

一步步洗脱过程导致错误累积;阅读高重复和同种多聚序列时有潜在困难

Complete Genomics

Blackbird

cPAL

荧光/光学

100

通量高;成本低;单测序步骤独立,使错误累积最低

低读长;模板制备妨碍长重复序列区域测序;样品制备费事

以上是关于二代测序技术总结的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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