Entrez Direct
Posted pxy7896
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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了Entrez Direct相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
安装
cd ~
/bin/bash
perl -MNet::FTP -e
‘$ftp = new Net::FTP("ftp.ncbi.nlm.nih.gov", Passive => 1);
$ftp->login; $ftp->binary;
$ftp->get("/entrez/entrezdirect/edirect.tar.gz");‘
gunzip -c edirect.tar.gz | tar xf -
rm edirect.tar.gz
builtin exit
export PATH=${PATH}:$HOME/edirect >& /dev/null || setenv PATH "${PATH}:$HOME/edirect"
./edirect/setup.sh
实例
esearch -db gene -query "SLC2A2" | efect -format gb > out.txt
以上是关于Entrez Direct的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章
linux command line 利用Entrez Direct下载NCBI数据